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）。用GS處理后很多問題，比如樣本、位點質(zhì)量控制（刪除一些空值或detect P較大位點等）很難實現(xiàn)，而且沒有看到幾篇文章僅依賴GS處理，一般也就用來讀個原始數(shù)據(jù)啥的。
回復(fù)此樓
。不知道你說的前期工作是指哪方面的？就我理解，一般都是樣品送給生物公司做實驗，然后得到原始數(shù)據(jù)和通用分析結(jié)果。拿到這些數(shù)據(jù)可以直接后續(xù)分析，也可以從原始數(shù)據(jù)（idat）開始基于一些R包（如，minfi等）重頭開始分析。蠻多文章使用R包分析，具體看你數(shù)據(jù)情況吧。
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