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doubleping新蟲 (小有名氣)
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[求助]
pcr-dgge分析土壤微生物群落要做平行樣嗎？
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| pcr-dgge分析土壤微生物群落要做平行樣嗎？我們實(shí)驗(yàn)室采的土樣都有三個(gè)重復(fù)處理，我做pcr-dgge實(shí)驗(yàn)也是三個(gè)重復(fù)樣品都做嗎？做dgge時(shí)候是三個(gè)平行樣并列排在一起嗎？數(shù)據(jù)分析時(shí)候怎么辦？是都要分析還是取平均值？不好意思，我知道這問題很淺顯，但是原諒我是我們學(xué)校第一個(gè)做pcr-dgge的，沒人帶著，而且我們院也沒人做微生物，自己也沒有微生物基礎(chǔ)，所以指望大家啦，十二萬分感謝 |
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doubleping
新蟲 (小有名氣)
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4樓2013-05-07 16:13:26
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一般不需要做平行。 既然你們已經(jīng)坐了3個(gè)重復(fù)樣品取樣，那可以將3個(gè)重復(fù)樣本分別取部分樣本混合后提取DNA作為該樣本進(jìn)行DGGE實(shí)驗(yàn)。這樣也可以彌補(bǔ)取樣時(shí)可能導(dǎo)致的微生物分布不均的問題。 當(dāng)然，如果你的樣本數(shù)目不是特別多，分為3個(gè)重復(fù)樣本跑DGGE也是可以的。 |
2樓2013-05-07 09:26:53
lhf903
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【答案】應(yīng)助回帖
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| 土壤微生物群落結(jié)構(gòu)很難說，有時(shí)候比較麻煩。同一個(gè)土樣的三個(gè)重復(fù)有時(shí)候提完DNA做PCR-DGGE也會(huì)有很大變化，如果你的三個(gè)重復(fù)土樣來自一塊田的話，建議你混合之后提一個(gè)DNA，如果是一個(gè)處理，三個(gè)小區(qū)里分別采了一個(gè)土樣的話，那就一份土樣提一個(gè)DNA~ |
3樓2013-05-07 10:13:31
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5樓2013-05-07 16:21:43
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