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jlf8858

銅蟲(chóng) (初入文壇)

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[求助] 完善進(jìn)化樹(shù)

最近做了個(gè)進(jìn)化樹(shù)，感覺(jué)不是太好，置信度有點(diǎn)低，很多都在50以下。我想問(wèn)問(wèn)什么樣的進(jìn)化樹(shù)才是成功的進(jìn)化樹(shù)，如果不好該怎么修正？

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1樓 2013-05-08 20:28:24

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螺旋的歌

銅蟲(chóng) (初入文壇)

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【答案】應(yīng)助回帖

★ ★ ★
laozuzunzhe: 金幣+3, 鼓勵(lì)應(yīng)助交流！ 2013-05-27 08:21:17

你的是菌的嗎？如果是菌的話，那真奇怪，BLAST之后應(yīng)該會(huì)有很多同屬或者同種的類(lèi)似序列，MAX IDENT都很高的，做出來(lái)的進(jìn)化樹(shù)的可信度數(shù)值應(yīng)該都會(huì)挺高的�？纯茨阕约旱倪M(jìn)化樹(shù)是否需要設(shè)置外群吧？一般發(fā)現(xiàn)新菌貌似可能性比較低。進(jìn)化樹(shù)的構(gòu)建，看你的目的所在，如果是為了確定菌的進(jìn)化地位的話，一般8-9株菌株進(jìn)行比較，我也看過(guò)很少的就3-4株菌株比較的，進(jìn)化樹(shù)關(guān)鍵是能夠體現(xiàn)你想要表達(dá)的信息。如果是蛋白質(zhì)之間的關(guān)系，進(jìn)化樹(shù)可能會(huì)龐大一些。

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回復(fù)此樓

2樓2013-05-27 00:07:22

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