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jlf8858銅蟲 (初入文壇)
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[求助]
完善進化樹
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| 最近做了個進化樹，感覺不是太好，置信度有點低，很多都在50以下。我想問問什么樣的進化樹才是成功的進化樹，如果不好該怎么修正？ |
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laozuzunzhe: 金幣+3, 鼓勵應(yīng)助交流！ 2013-05-27 08:21:17
| 你的是菌的嗎？如果是菌的話，那真奇怪，BLAST之后應(yīng)該會有很多同屬或者同種的類似序列，MAX IDENT都很高的，做出來的進化樹的可信度數(shù)值應(yīng)該都會挺高的。看看你自己的進化樹是否需要設(shè)置外群吧？一般發(fā)現(xiàn)新菌貌似可能性比較低。進化樹的構(gòu)建，看你的目的所在，如果是為了確定菌的進化地位的話，一般8-9株菌株進行比較，我也看過很少的就3-4株菌株比較的，進化樹關(guān)鍵是能夠體現(xiàn)你想要表達的信息。如果是蛋白質(zhì)之間的關(guān)系，進化樹可能會龐大一些。 |
2樓2013-05-27 00:07:22
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