| 5 | 1/1 | 返回列表 |
| 查看: 451 | 回復: 2 | ||
| 當前只顯示滿足指定條件的回帖,點擊這里查看本話題的所有回帖 | ||
wenwen4599金蟲 (正式寫手)
|
[求助]
請做系統(tǒng)進化或系統(tǒng)地理的筒子們進來看一下,幫幫忙。
|
|
|
最近在分析數(shù)據的時候發(fā)現(xiàn)一個奇怪的問題。想請大家?guī)兔μ峁┮恍﹨⒖嫉囊庖姟?br />
我是做系統(tǒng)地理的,在研究過程中擴了兩個近緣種的兩個線粒體基因(16S和CO1)和兩個核基因(PEPCK和H3)。 做系統(tǒng)發(fā)生分析的時候發(fā)現(xiàn)一個物種其中一個遺傳分支(分布區(qū)很廣)的CO1基因全部只有一個單元型(有差不多三五十個個體,多個種群的)。而較CO1基因更為保守的16S雖然單元型不多,但是也有5個單元型,甚至H3基因都有兩個單元型。但是這種情況只發(fā)生在這個遺傳分支中。該物種的另一個遺傳分支單元型非常豐富。另外一個物種的單元型雖然并不多,但也很正常,單元型上來看CO1基因多于16S,線粒體基因多于核基因。 老板提出是不是在擴增的過程中污染了,我覺得這個可能性很小。雖然不是每次都做了空白對照,但是多數(shù)情況下還是有空白對照的。另外一批模板同時也擴增的16S中的不同個體間是有序列變異的。如果是引物的問題,另一個物種和另一個支系的單元型卻明顯有差異。 請大家不吝賜教,如果有一些理論可以解釋這個現(xiàn)象,最好把參考文獻列一下,謝謝大家! |
榮譽版主 (知名作家)
海納百川

金蟲 (正式寫手)
| 最具人氣熱帖推薦 [查看全部] | 作者 | 回/看 | 最后發(fā)表 | |
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 考研調劑 +3 | 呼呼?~+123456 2026-03-21 | 3/150 |
|
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 0703化學調劑 +4 | 妮妮ninicgb 2026-03-21 | 4/200 |
|
|
[考研] 生物學一志愿985,分數(shù)349求調劑 +3 | zxts12 2026-03-21 | 3/150 |
|
|
[考研] 279求調劑 +5 | 紅衣隱官 2026-03-21 | 5/250 |
|
|
[考研] 求調劑 +3 | 白QF 2026-03-21 | 3/150 |
|
|
[考研] 0856材料專碩353求調劑 +3 | NIFFFfff 2026-03-20 | 3/150 |
|
|
[考研] 08工科 320總分 求調劑 +6 | 梨花珞晚風 2026-03-17 | 6/300 |
|
|
[考研] 085700資源與環(huán)境308求調劑 +12 | 墨墨漠 2026-03-18 | 13/650 |
|
|
[考研] 一志愿南昌大學,327分,材料與化工085600 +9 | Ncdx123456 2026-03-19 | 9/450 |
|
|
[考研] 304求調劑 +7 | 司空. 2026-03-18 | 7/350 |
|
|
[考研] 一志愿中南化學(0703)總分337求調劑 +8 | niko- 2026-03-19 | 9/450 |
|
|
[考研] 材料學碩297已過四六級求調劑推薦 +11 | adaie 2026-03-19 | 11/550 |
|
|
[考研] 0817 化學工程 299分求調劑 有科研經歷 有二區(qū)文章 +22 | rare12345 2026-03-18 | 22/1100 |
|
|
[考研] 261求B區(qū)調劑,科研經歷豐富 +3 | 牛奶很忙 2026-03-20 | 4/200 |
|
|
[考研] 材料學碩318求調劑 +5 | February_Feb 2026-03-19 | 5/250 |
|
|
[考研]
|
胡辣湯放糖 2026-03-15 | 6/300 |
|
|
[考研] 283求調劑 +3 | 聽風就是雨; 2026-03-16 | 3/150 |
|
|
[考研] [導師推薦]西南科技大學國防/材料導師推薦 +3 | 尖角小荷 2026-03-16 | 6/300 |
|
|
[考研] 333求調劑 +3 | 文思客 2026-03-16 | 7/350 |
|
|
[考研] 318求調劑 +3 | Yanyali 2026-03-15 | 3/150 |
|