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emanlee木蟲 (小有名氣)
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[求助]
如何理解RNA-Seq基因表達數(shù)據(jù)（Count，或 FPKM）服從泊松分布
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請問如何理解微陣列基因表達數(shù)據(jù)服從正態(tài)分布？是指一個Array中的表達數(shù)據(jù)，還是全部數(shù)據(jù)合在一起？ 請問如何理解RNA-Seq基因表達數(shù)據(jù)（Count，或 FPKM）服從泊松分布，負二項分布？ |
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1 應(yīng)該是指一個array中的數(shù)據(jù)就是正態(tài)分布，因為常用的t檢驗法篩選差異基因都是一個array一個array來進行的，也就是認為每個array都服從正態(tài)分布了 2 在RNA-Seq中，每個基因會對應(yīng)多少個讀段是一個計數(shù)型的隨機變量，計數(shù)型隨機變量分布類型通常就是離散分布里面那幾個，泊松分布是最常見的一個了，加上有通常假定每個read在基因組序列上是均勻分布的，故一個基因?qū)?yīng)的read數(shù)服從速率恒定的泊松分布（當(dāng)然也可以推廣至速率變化的泊松分布，那就得改變前提假設(shè)了） 以上是個人理解，希望有幫助！多多交流！   |
2樓2013-05-13 09:42:45
emanlee
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