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emanlee木蟲 (小有名氣)
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[求助]
如何理解RNA-Seq基因表達(dá)數(shù)據(jù)（Count，或 FPKM）服從泊松分布
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請(qǐng)問如何理解微陣列基因表達(dá)數(shù)據(jù)服從正態(tài)分布？是指一個(gè)Array中的表達(dá)數(shù)據(jù)，還是全部數(shù)據(jù)合在一起？ 請(qǐng)問如何理解RNA-Seq基因表達(dá)數(shù)據(jù)（Count，或 FPKM）服從泊松分布，負(fù)二項(xiàng)分布？ |
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1 應(yīng)該是指一個(gè)array中的數(shù)據(jù)就是正態(tài)分布，因?yàn)槌Ｓ玫膖檢驗(yàn)法篩選差異基因都是一個(gè)array一個(gè)array來進(jìn)行的，也就是認(rèn)為每個(gè)array都服從正態(tài)分布了 2 在RNA-Seq中，每個(gè)基因會(huì)對(duì)應(yīng)多少個(gè)讀段是一個(gè)計(jì)數(shù)型的隨機(jī)變量，計(jì)數(shù)型隨機(jī)變量分布類型通常就是離散分布里面那幾個(gè)，泊松分布是最常見的一個(gè)了，加上有通常假定每個(gè)read在基因組序列上是均勻分布的，故一個(gè)基因?qū)?yīng)的read數(shù)服從速率恒定的泊松分布（當(dāng)然也可以推廣至速率變化的泊松分布，那就得改變前提假設(shè)了） 以上是個(gè)人理解，希望有幫助！多多交流！   |
2樓2013-05-13 09:42:45
emanlee
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3樓2013-05-13 15:20:02
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4樓2013-05-13 15:35:56
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8樓2013-07-05 11:38:45
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