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小木蟲論壇-學術科研互動平臺 » 生物醫(yī)藥區(qū) » 分子生物 » 綜合其他 » 宏基因組的ORF預測
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mengbiotech金蟲 (小有名氣)
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[求助]
宏基因組的ORF預測 已有1人參與
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大家好，我是做宏基因組的�，F(xiàn)在在ORF預測上比較糾結。 因為看到很多文獻的方法是不一樣的。 有的用NCBI 的ORF Finder，這個得到的ORF最多； 有的用MetaGeneMark for MetaGenome Gene Finding，這個比較少，35 kb的能預測到25個左右，SCIENCE有篇文章是用這個；還有篇NATURE用的是SoftBerry，沒試過。 有沒有同學了解的？他們之間是存在誤差的，但是具體哪個好，估計也很難說出來。 大家說說自己的經(jīng)驗吧 謝謝！ |
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