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mengbiotech金蟲 (小有名氣)
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[求助]
宏基因組的ORF預(yù)測(cè) 已有1人參與
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大家好，我是做宏基因組的。現(xiàn)在在ORF預(yù)測(cè)上比較糾結(jié)。 因?yàn)榭吹胶芏辔墨I(xiàn)的方法是不一樣的。 有的用NCBI 的ORF Finder，這個(gè)得到的ORF最多； 有的用MetaGeneMark for MetaGenome Gene Finding，這個(gè)比較少，35 kb的能預(yù)測(cè)到25個(gè)左右，SCIENCE有篇文章是用這個(gè)；還有篇NATURE用的是SoftBerry，沒試過。 有沒有同學(xué)了解的？他們之間是存在誤差的，但是具體哪個(gè)好，估計(jì)也很難說出來。 大家說說自己的經(jīng)驗(yàn)吧 謝謝！ |
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mengbiotech
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3樓2013-05-14 08:58:36
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2樓2013-05-13 22:14:44
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5樓2013-05-14 10:03:16
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