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含羞草liu新蟲 (小有名氣)
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[求助]
如何去除RNA提取過程中的蛋白質(zhì)污染
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大家好!我目前正在構(gòu)建cDNA文庫,需要高質(zhì)量的RNA。提取的材料是楊樹葉片,最先我是用Trizol 提取的,提取到的RNA對(duì)OD值檢測,發(fā)現(xiàn)OD260/OD280的范圍在1.8~2.0之間,但電泳檢測時(shí)加樣孔總會(huì)發(fā)亮,也就是會(huì)有蛋白質(zhì)的污染,直接用此法提取的RNA構(gòu)建文庫時(shí)總是很不理想。后來,我在takara 購買了RNAiso 試劑配合Fruit-mate試劑進(jìn)行提。ㄟ@兩種試劑是針對(duì)多糖多酚植物材料的),提取后檢測,OD260/OD280的范圍在1.8~2.0之間,但電泳時(shí)加樣孔也會(huì)發(fā)亮,此法也不能有效的去除蛋白質(zhì)。之后,我對(duì)Trizol提取后的RNA進(jìn)行LiCL沉淀,配制5M LiCL沉淀液(配制方法為:稱取LiCL 42.4g,Tris 0.4846g,EDTA 0.5846g溶于150ml DEPC處理水中,用5N NaOH 高PH 為7.4,之后DEPC處理水定容到200ml,高壓滅菌),等量加入提取后的RNA中,-80度靜置兩小時(shí),拿出后4度,14000rpm離心20min, 棄上清,可看到半透明狀的沉淀。用預(yù)冷的75%乙醇清洗沉淀一次,7500rpm 離心5min,發(fā)現(xiàn)沉淀變成乳白色,加DEPC處理水,發(fā)現(xiàn)此沉淀很難溶解(已室溫靜置約10min,不溶,進(jìn)行漩渦振蕩,也不溶),隨后,直接用此未完全溶解的RNA提取樣進(jìn)行檢測,發(fā)現(xiàn)OD260/OD280大于1.8,有的甚至在2.0以上 ,但制膠電泳檢測,加樣孔仍會(huì)發(fā)亮,蛋白質(zhì)仍舊沒有除盡。 對(duì)于此文庫構(gòu)建,我已進(jìn)行半年多,仍舊沒有進(jìn)展,問題總是出現(xiàn)在RNA的提取上。究竟要怎樣才能除盡RNA中的蛋白質(zhì)呢?請(qǐng)高手幫忙,感激不盡。! |

新蟲 (小有名氣)

鐵桿木蟲 (職業(yè)作家)
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