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星期五13木蟲(chóng) (正式寫(xiě)手)
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16sRNA系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)與生化試驗(yàn)結(jié)果不一致，該如何處理？
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我在環(huán)境中篩選一株細(xì)菌，做16sRNA測(cè)序，分析是假單胞菌屬，然后做了Vitek自動(dòng)鑒定，結(jié)果是惡臭假單胞菌。我選擇了20種假單胞菌屬中的標(biāo)準(zhǔn)菌種，用mega做系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)，可是無(wú)論怎么做我篩選的菌種都不和惡臭假單胞菌在一起。這種情況怎么辦？ 進(jìn)化樹(shù).jpg |
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9樓2013-05-20 22:29:59
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2樓2013-05-18 08:45:38
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3樓2013-05-18 12:54:55
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4樓2013-05-18 15:29:05
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5樓2013-05-18 21:36:53
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8樓2013-05-20 14:29:48
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送紅花一朵 |
我發(fā)現(xiàn)構(gòu)建進(jìn)化樹(shù)好像有很多問(wèn)題。我現(xiàn)在把我構(gòu)建進(jìn)化樹(shù)種的幾個(gè)菌種剔除后，可以把我的菌株和惡臭芽孢桿菌放到一個(gè)簇里面了。在構(gòu)建進(jìn)化樹(shù)中有沒(méi)有什么標(biāo)準(zhǔn)？ 我聯(lián)系過(guò)生物所做菌種鑒定，算上菌落形態(tài)，革蘭氏染色總共才10多個(gè)實(shí)驗(yàn)結(jié)果，就確定到了種。好像是按照伯杰氏手冊(cè)來(lái)判斷的，要加3000多，我覺(jué)得太虧了。哈哈 |
10樓2013-05-22 15:48:02
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