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s24512453新蟲 (初入文壇)
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藍(lán)白斑篩選實(shí)驗中對照組平板長出很多菌落 但是實(shí)驗組平板上一個菌落沒有
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1.PCR擴(kuò)增出1000bp的目的基因,電泳后膠回收,目的基因兩端的酶切位點(diǎn)分別是ECOR1和BAMH1(引物是自己設(shè)計) 2.對質(zhì)粒pUC18(2686bp,具有氨芐抗性,可用于藍(lán)白斑篩選)進(jìn)行雙酶切,兩個酶分別是寶生物的ECOR1和BAMH1(這兩個酶的酶切buffer和酶切溫度都不相同,通用buffer表中建議使用bufferK,在bufferK中ECOR1的酶切效率是120,BAMH1是100,那個120讓我很詫異)。按照說明書添加相應(yīng)的量,先30℃ECOR1酶切5min,之后再37℃BAMH1酶切5min(3h以及過夜都試過)。分別設(shè)立單酶切對照組:ECOR1 30度單酶切、BAMH1 37度單酶切(對照試驗buffer都是K)。電泳檢測表明三者都處于同一位置的條帶上,(單酶切都切開了,雙酶切應(yīng)該沒有問題)而未經(jīng)過酶切的質(zhì)粒則單獨(dú)在另一位置,相差500bp左右。之后對雙酶切質(zhì)粒進(jìn)行膠回收。 3對目的片段進(jìn)行雙酶切,條件同上,電泳之后膠回收(酶切之前目的片段已經(jīng)是經(jīng)過膠回收后的,酶切后再進(jìn)行回收,條帶很暗,但是還是有,濃度無法精確估計)。 4目的片段和質(zhì)粒的鏈接:采用寶生物的鏈接試劑盒,載體和目的片段的比例試過1:10和1:3,加入solution1后16度半小時(16度過夜也試過)。 5將重組質(zhì)粒轉(zhuǎn)化到大腸桿菌感受態(tài)細(xì)胞(寶生物)中,轉(zhuǎn)化過程都按照說明書進(jìn)行,對照組是空質(zhì)粒pUC18和無菌水。加入無菌水的平板不長菌(大腸桿菌本身沒有氨芐抗性);空質(zhì)粒pUC18的平板都是藍(lán)色菌落(說明pUC18進(jìn)入了大腸,表達(dá)了氨芐抗性),重組質(zhì)粒的平板上什么菌都沒有(長時間培養(yǎng)也沒有,4度冰箱長時間放置也沒有) 寫的過于繁雜,但求高手指點(diǎn)。! |
鐵桿木蟲 (職業(yè)作家)
| 目的片段設(shè)計酶切位點(diǎn)的5‘端是否加了保護(hù)堿基?雖然EcoRI和BamHI都是很好用的酶,切目的片段時由于位點(diǎn)位于片段的尾端,酶切時間也應(yīng)該適當(dāng)延長來確保酶切效率。此外,目的片段做了兩次膠回收,損失會比較大。如果PCR只有一條帶,PCR后和酶切后都可以不用膠回收,直接用PCR產(chǎn)物回收kit就可以了。 |
新蟲 (初入文壇)
鐵桿木蟲 (職業(yè)作家)
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