 |
 |
 |
 |
 |
 |
||
 |
 |
 |
 |
 |
| 10 | 1/1 | 返回列表 |
| 查看: 2518 | 回復(fù): 9 | ||
fengshaxia21鐵蟲 (初入文壇)
|
[求助]
SPC水分子模型，求密度有些許問題 已有1人參與
|
|
RT，我用MS建立了一個6000分子的SPC水分子模型。但是得到的在293K的密度總是0.96這樣，距離實際值或者SPC水分子的實驗值都有0.2～0.3的差距（雖然看上去不算大，不過這沒關(guān)系嗎？） 我想知道這是什么導(dǎo)致的，density=mass(all)/(參數(shù)*vol)，但是mass是不變的，密度的體積就只跟體積有關(guān)了。為什么在溫度到達293附近的時候波動還比較大（270～300上下波動），密度的波動（0.95～0.97上下波動）。請大牛們幫我分析一下到底哪里有問題。 in文件和data文件如下： in文件： units real dimension 3 boundary p p p atom_style full pair_style lj/cut/coul/long 9.0 9.0 bond_style harmonic angle_style harmonic kspace_style pppm 1.0e-4 read_data water.lammps05 neighbor 2.0 bin neigh_modify delay 5 every 1 velocity all create 298 4928459 dist uniform variable density equal mass(all)*10/(6.0221417930*vol) timestep 0.01 thermo 2000 thermo_style custom step temp press vol etotal v_density fix fixShake all shake 0.0001 100 0 b 1 a 1 fix 1 all npt temp 293.0 293.0 100 iso 1.0 1.0 1000 drag 0.2 run 100000 unfix 1 fix 2 all nve dump 1 all custom 1000 dumpnve.lammpstrj id type xu yu zu run 10000 data文件： LAMMPS 2005 data file for water 6000 atoms 4000 bonds 2000 angles 0 dihedrals 0 impropers 2 atom types 1 bond types 1 angle types 0.000000000 39.107300000 xlo xhi 0.000000000 39.107300000 ylo yhi 0.000000000 39.107300000 zlo zhi Masses 1 15.999400 2 1.007970 Pair Coeffs 1 0.1553000000 3.1660000000 2 0.0000000000 0.0000000000 Bond Coeffs 1 450 1 Angle Coeffs 1 47.0000 109.4700 Atoms 1 1 1 -0.82 7.597767833 9.408946512 5.391758138 2 1 2 0.41 6.641116667 9.263121029 5.557195421 3 1 2 0.41 7.756749235 8.739511125 4.691137645 …… |
回復(fù)此樓» 猜你喜歡
306求調(diào)劑
已經(jīng)有5人回復(fù)
-
284求調(diào)劑
已經(jīng)有4人回復(fù)
-
尋找調(diào)劑
已經(jīng)有4人回復(fù)
-
一志愿中南化學(xué)（0703）總分337求調(diào)劑
已經(jīng)有10人回復(fù)
-
324求調(diào)劑
已經(jīng)有6人回復(fù)
-
一志愿 西北大學(xué) ，070300化學(xué)學(xué)碩，總分287，雙非一本，求調(diào)劑。
已經(jīng)有3人回復(fù)
-
289求調(diào)劑
已經(jīng)有7人回復(fù)
-
319求調(diào)劑
已經(jīng)有4人回復(fù)
-
298求調(diào)劑一志愿211
已經(jīng)有3人回復(fù)
-
求調(diào)劑一志愿海大，0703化學(xué)學(xué)碩304分，有大創(chuàng)項目，四級已過
已經(jīng)有8人回復(fù)
» 本主題相關(guān)商家推薦: (我也要在這里推廣)
» 本主題相關(guān)價值貼推薦，對您同樣有幫助:
- TIP3P 和 SPC/E 適用的體系
已經(jīng)有7人回復(fù)
liuasia
銅蟲 (小有名氣)
- 應(yīng)助: 0 (幼兒園)
- 金幣: 102.6
- 散金: 200
- 帖子: 69
- 在線: 122.6小時
- 蟲號: 3001880
- 注冊: 2014-02-27
- 性別: GG
- 專業(yè): 藝術(shù)美學(xué)
2樓2014-04-09 16:10:49
laughingjudy
新蟲 (初入文壇)
- 應(yīng)助: 0 (幼兒園)
- 金幣: 185.8
- 帖子: 33
- 在線: 31.5小時
- 蟲號: 2738781
- 注冊: 2013-10-20
- 專業(yè): 工程熱物理相關(guān)交叉領(lǐng)域
3樓2014-06-13 14:59:07
4樓2014-06-18 21:18:19
5樓2014-08-29 22:03:44
chibang367
銀蟲 (小有名氣)
- 應(yīng)助: 0 (幼兒園)
- 金幣: 863.2
- 紅花: 1
- 帖子: 197
- 在線: 78.3小時
- 蟲號: 4191967
- 注冊: 2015-11-02
- 性別: MM
- 專業(yè): 工程熱物理與能源利用
6樓2016-03-06 23:11:56
cuso4852cuoh
新蟲 (小有名氣)
- 應(yīng)助: 0 (幼兒園)
- 金幣: 223.4
- 散金: 20
- 帖子: 170
- 在線: 49.6小時
- 蟲號: 1481571
- 注冊: 2011-11-08
- 專業(yè): 工程熱物理相關(guān)交叉領(lǐng)域
7樓2018-11-15 08:37:03
餓魚cxy
金蟲 (正式寫手)
- 應(yīng)助: 3 (幼兒園)
- 金幣: 2978.9
- 帖子: 403
- 在線: 81.4小時
- 蟲號: 4038424
- 注冊: 2015-08-26
- 專業(yè): 工程熱物理相關(guān)交叉領(lǐng)域
8樓2018-12-12 14:08:21
cuso4852cuoh
新蟲 (小有名氣)
- 應(yīng)助: 0 (幼兒園)
- 金幣: 223.4
- 散金: 20
- 帖子: 170
- 在線: 49.6小時
- 蟲號: 1481571
- 注冊: 2011-11-08
- 專業(yè): 工程熱物理相關(guān)交叉領(lǐng)域
9樓2018-12-27 21:18:42
cuso4852cuoh
新蟲 (小有名氣)
- 應(yīng)助: 0 (幼兒園)
- 金幣: 223.4
- 散金: 20
- 帖子: 170
- 在線: 49.6小時
- 蟲號: 1481571
- 注冊: 2011-11-08
- 專業(yè): 工程熱物理相關(guān)交叉領(lǐng)域
10樓2019-03-09 13:57:29
相關(guān)版塊跳轉(zhuǎn)
我要訂閱樓主 fengshaxia21 的主題更新
| 10 | 1/1 | 返回列表 |
| 最具人氣熱帖推薦 [查看全部] | 作者 | 回/看 | 最后發(fā)表 | |
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 319求調(diào)劑 +4 | 小力氣珂珂 2026-03-20 | 4/200 |
|
|---|---|---|---|---|
|
|
[考研] 275求調(diào)劑 +6 | shansx 2026-03-22 | 8/400 |
|
|
[考研] 08工科 320總分 求調(diào)劑 +8 | 梨花珞晚風(fēng) 2026-03-17 | 8/400 |
|
|
|
[考研] 招08考數(shù)學(xué) +3 | laoshidan 2026-03-20 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 354求調(diào)劑 +7 | Tyoumou 2026-03-18 | 10/500 |
|
|
|
[考博] 招收博士1-2人 +3 | QGZDSYS 2026-03-18 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 求調(diào)劑 +3 | 13341 2026-03-20 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 307求調(diào)劑 +3 | 余意卿 2026-03-18 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 265求調(diào)劑 +9 | 梁梁校校 2026-03-17 | 9/450 |
|
|
|
[考研] 288求調(diào)劑 +16 | 于海海海海 2026-03-19 | 16/800 |
|
|
|
[考研] 350求調(diào)劑 +5 | weudhdk 2026-03-19 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 材料與化工求調(diào)劑 +7 | 為學(xué)666 2026-03-16 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 0703化學(xué)調(diào)劑 +5 | pupcoco 2026-03-17 | 8/400 |
|
|
|
[考研] 344求調(diào)劑 +6 | knight344 2026-03-16 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 085601專碩，總分342求調(diào)劑，地區(qū)不限 +5 | share_joy 2026-03-16 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 0703化學(xué)調(diào)劑 +3 | 妮妮ninicgb 2026-03-17 | 3/150 |
|
|
|
[考博] 26申博 +4 | 八6八68 2026-03-16 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 302求調(diào)劑 +4 | 小賈同學(xué)123 2026-03-15 | 8/400 |
|
|
|
[考研] 283求調(diào)劑 +3 | 聽風(fēng)就是雨； 2026-03-16 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 333求調(diào)劑 +3 | 文思客 2026-03-16 | 7/350 |
|