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北京石油化工學(xué)院2026年研究生招生接收調(diào)劑公告

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sp-semon

金蟲(chóng) (小有名氣)

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專(zhuān)業(yè): 理論和計(jì)算化學(xué)

[求助] 優(yōu)化結(jié)構(gòu)finished，但是OUTCAR中沒(méi)有信息。求助�。。。�！

這是INCAR：

# Basic setup:
SYSTEM = Cp2

# Accuracy controls:
PREC = High

# Use default energy cutoff for PREC

# Electronic loop controls:
ALGO = VeryFast # VeryFast (RMM-DIIS)
EDIFF = 0.000100
NELMIN = 6
SIGMA = 0.200000 # eV

# Relaxation control:
IBRION = 1 ; SMASS = 0  # Quasi-Newton (RMM-DIIS)
NSW = 50
POTIM = 0.400000
ISIF = 2
EDIFFG = 0.000500

# Properties:
LCHARG = .TRUE.
LWAVE = .TRUE.
LELF = .TRUE.
LVTOT = .TRUE.
LVHAR = .TRUE.
LREAL = .ON.
計(jì)算正常結(jié)束，但是OUTCAR中只有這些信息：

vasp.5.2.2 15Apr09 complex
executed on          LinuxIFC date 2013.06.04  19:52:02
running on 8 nodes
distr:  one band on 1 nodes, 8 groups

--------------------------------------------------------------------------------------------------------

INCAR:
POTCAR: PAW C 31May2000
POTCAR: PAW Fe 03Mar1998
POTCAR: PAW H 06May1998
請(qǐng)教大蝦這是那里的問(wèn)題呢？
另外多個(gè)文件都是空的，如CHG，CHGCAR。CONTCAR等~~~

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1樓 2013-06-05 09:15:00

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171713294

木蟲(chóng) (正式寫(xiě)手)

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【答案】應(yīng)助回帖

★
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
sunyang1988: 金幣+1, 謝謝提示 2013-06-05 16:54:07

建議你重新啟動(dòng)一下機(jī)器看看

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堅(jiān)持，不放棄

2樓2013-06-05 09:32:26

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sp-semon

金蟲(chóng) (小有名氣)

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引用回帖:

2樓: Originally posted by 171713294 at 2013-06-05 09:32:26
建議你重新啟動(dòng)一下機(jī)器看看

我是在網(wǎng)格上算的，任務(wù)交了好幾次了，都是這個(gè)樣子？會(huì)不會(huì)跟版本有關(guān)系呢？
多指點(diǎn)一下~~謝謝~~

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3樓2013-06-07 22:09:41

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sp-semon

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自己頂一下�。。“萃忻靼椎娜酥更c(diǎn)一下�。�！

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4樓2013-06-08 16:25:57

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KalaShayminS

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【答案】應(yīng)助回帖

★ ★
franch: 金幣+2, 謝謝回帖交流。。 2013-06-10 20:12:15

把標(biāo)準(zhǔn)輸出和標(biāo)準(zhǔn)錯(cuò)誤的內(nèi)容貼上來(lái)看看

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5樓2013-06-08 21:05:06

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porominix

銀蟲(chóng) (小有名氣)

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【答案】應(yīng)助回帖

★ ★
franch: 金幣+2, 謝謝回帖交流。。 2013-06-10 20:12:21

是不是輸出文件存放的文件夾的名稱(chēng)含有中文或者空格？

[ 發(fā)自手機(jī)版 http://www.gaoyang168.com/3g ]

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6樓2013-06-10 15:05:06

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這是Info.out文件的內(nèi)容：

Parse 1371124731106335502.xml success!
Create .job.
create .job success!
create .submit
create_dot_submit success!
Working directory is : ~/sce/workspace/8113
stage in files
find: /export/lsf/perf/license/7.0: No such file or directory
find: /export/lsf/perf/license/7.0: 沒(méi)有那個(gè)文件或目錄
find: /export/lsf/perf/license/7.0: No such file or directory
find: /export/lsf/perf/license/7.0: 沒(méi)有那個(gè)文件或目錄
find: /export/lsf/perf/license/7.0: No such file or directory
find: /export/lsf/perf/license/7.0: 沒(méi)有那個(gè)文件或目錄
stagein_files success!
job_sub
Job <525926> is submitted to queue <normal>.
job_sub success!
set fs job status to 17
Report to center server start......

Report success!
set fs job status to 17
set cs job status to 18
Report to center server start......

Report success!
set fs job status to 18
add stage out lock
do stagingout from hpc to fs
In 10.9.1.251:~/sce/workspace/8113, rm ~/.JSDL/1371124731106335502; rm Info.out;
find: /export/lsf/perf/license/7.0: No such file or directory
find: /export/lsf/perf/license/7.0: 沒(méi)有那個(gè)文件或目錄
stageout_files(delete tmp files) success!
do staginout from fs to cs

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7樓2013-06-13 12:43:14

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這是stdout文件內(nèi)容：

Sender: LSF System <lsfadmin@c0111>
Subject: Job 525926: </export/home/user167/.JSDL/1371124731106335502/1371124731106335502.job> Done

Job </export/home/user167/.JSDL/1371124731106335502/1371124731106335502.job> was submitted from host <console> by user <user167> in cluster <Lenovo1800>.
Job was executed on host(s) <8*c0111>, in queue <normal>, as user <user167> in cluster <Lenovo1800>.
</export/home/user167> was used as the home directory.
</export/home/user167/sce/workspace/8113> was used as the working directory.
Started at Tue Jun  4 10:45:54 2013
Results reported at Tue Jun  4 10:46:00 2013

Your job looked like:

------------------------------------------------------------
# LSBATCH: User input
/export/home/user167/.JSDL/1371124731106335502/1371124731106335502.job
------------------------------------------------------------

Successfully completed.

Resource usage summary:

CPU time :    0.63 sec.
Max Memory :       3 MB
Max Swap :       31 MB

Max Processes  :       1
Max Threads :       1

The output (if any) follows:

running on 8 nodes
distr:  one band on 1 nodes, 8 groups
vasp.5.2.2 15Apr09 complex
POSCAR found :  3 types and  211 ions
Error reading item 'LREAL' from file INCAR.
Error code was IERR=5 ... . Found N= 4 data.
Job  /export/lsf/7.0/linux2.6-glibc2.3-x86_64/bin/intelmpi_wrapper /export/home/sce/gridapp/VASP-5.2/vasp.5.2/vasp.cli

TID HOST_NAME COMMAND_LINE          STATUS          TERMINATION_TIME
===== ========== ================  =======================  ===================
00000 c0111    /export/home/sce  Done                   06/04/2013 10:45:57
00001 c0111    /export/home/sce  Done                   06/04/2013 10:45:57
00002 c0111    /export/home/sce  Done                   06/04/2013 10:45:57
00003 c0111    /export/home/sce  Done                   06/04/2013 10:45:57
00004 c0111    /export/home/sce  Done                   06/04/2013 10:45:57
00005 c0111    /export/home/sce  Done                   06/04/2013 10:45:57
00006 c0111    /export/home/sce  Done                   06/04/2013 10:45:57
00007 c0111    /export/home/sce  Done                   06/04/2013 10:45:57
Total cpucount is:8
Total runtime is:0d0h0m6s.

PS:

Read file <stderr> for stderr output of this job.

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8樓2013-06-13 12:44:05

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stderr文件是空的。
這是job.sub的內(nèi)容：

find: /export/lsf/perf/license/7.0: No such file or directory
find: /export/lsf/perf/license/7.0: 沒(méi)有那個(gè)文件或目錄
Job <525926> is submitted to queue <normal>.

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9樓2013-06-13 12:45:28

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引用回帖:

5樓: Originally posted by KalaShayminS at 2013-06-08 21:05:06
把標(biāo)準(zhǔn)輸出和標(biāo)準(zhǔn)錯(cuò)誤的內(nèi)容貼上來(lái)看看

內(nèi)容已經(jīng)上傳，麻煩看一下是哪里的問(wèn)題。麻煩了~~

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10樓2013-06-13 12:46:15

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