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[求助]
甲基化思路
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想請教各位做甲基化的大俠 大家做甲基化都是什么思路啊? 我知道這問題有點大 但是偶想聽聽各種思路 基于高通量測序的甲基化是什么思路 分子實驗的甲基化是什么思路 ![]() ![]() ![]() |
核酸生物學(xué)實驗經(jīng)驗 |


專家顧問 (知名作家)
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專家經(jīng)驗: +218 |
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DNA甲基化的高通量測序的基本方法可以分為兩大類: 1.非質(zhì)譜方法:比如重亞硫酸鹽測序方法檢測DNAde甲基化;甲基化-敏感性單鏈構(gòu)想分析;DNA的甲基化改變的變性梯度膠電泳;DNA的甲基化特異性寡核苷酸生物芯片分析,生物芯片分析也能夠用于DNA測序等等。 2.質(zhì)譜方法:測定DNA甲基化修飾之后的相對分子量變化,MS-MS既可以用測定多肽序列,也可以用于測定寡核苷酸序列,可以在測定甲基化特異性寡核苷酸序列前用限制性內(nèi)切酶切開DNA,不含有修飾的DNA部分可直接用酶法和化學(xué)法測定,剩下的有修飾的部分DNA片段用MS-MS。 參考文獻: 1.MMB 507-DNA methylation,which is one of Methods in Molecular Biology Series.http://www.gaoyang168.com/bbs/viewthread.php?tid=6015850 2.John N. Abelson Melvin I. Simon ect .,Method in Enzymology Vol-402,Biological Mass Spectrometry,Elsevier Inc,2005. http://www.gaoyang168.com/bbs/viewthread.php?tid=5795342 專門講核酸的質(zhì)譜實驗的書現(xiàn)在不在我手里。抱歉! |

專家顧問 (知名作家)
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專家經(jīng)驗: +218 |
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DNA甲基化的測序的研究是現(xiàn)在研究的熱點表觀遺傳學(xué)研究中的DNA甲基化的結(jié)構(gòu)和功能影響的第一步,或者說起點,沒有這一步,DNA甲基化(本身就是生命科學(xué)的研究最前沿之一)的生物效應(yīng)只是空中樓閣。DNA甲基化不被認為是DNA的堿基序列發(fā)生了改變,即遺傳物質(zhì)未變生物體的表達性狀卻改變了。 高通量DNA的甲基化測序研究本身也是高通量DNA測序的一個重大進展。DNA的核苷和堿基的修飾種類很多,這些修飾成分都不能用常規(guī)的酶法和化學(xué)法測定。 最好的高通量DNA的修飾成分的測序是質(zhì)譜方法:測定DNA甲基化修飾之后的相對分子量變化,MS-MS既可以用測定多肽序列,也可以用于測定寡核苷酸序列,可以在測定甲基化特異性寡核苷酸序列前用限制性內(nèi)切酶切開DNA,不含有修飾的DNA部分可直接用酶法和化學(xué)法測定,剩下的有修飾的部分DNA片段用MS-MS。目前是需要很大的發(fā)展。 |



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