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[求助]
怎樣預測一批mirna的靶基因
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| 我把一批miRNA放到一個txt文件里，想預測miRNA的靶基因，targetscan和mirbase都只可以單個輸入，求解決方案，謝謝 |
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3樓2013-07-11 11:31:21
我要學perl么
新蟲 (初入文壇)
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- 專業(yè): 發(fā)育生物學
【答案】應助回帖
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去官方網(wǎng)站下程序、miRNA種子序列以及多序列比對等數(shù)據(jù)可以預測。 另外有一種方法也可以預測。比如說targetscan網(wǎng)站，當你輸入mmu-miR-148a的時候得到結果的網(wǎng)址如下： http://www.targetscan.org/cgi-bin/targetscan/vert_61/targetscan.cgi?species=Human&gid=&mir_sc=&mir_c=&mir_nc=&mirg=mmu-miR-148a 網(wǎng)址后綴不同的地方是mmu-miR-148a，其他部分都一樣。因此可以根據(jù)你的miRNA名稱文件，得到一批對于的網(wǎng)址，然后解析可以得到結果。具體可以用perl編程。 |
2樓2013-07-10 17:25:38
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