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cinema1980木蟲 (著名寫手)
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[求助]
青基 11205061 基于新一代測序數(shù)據(jù)的非比對統(tǒng)計功效的研究 摘要
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ahwzc
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【答案】應(yīng)助回帖
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cinema1980: 金幣+50, 基金HEPI+1, ★★★★★最佳答案, 摘要已收到，謝謝！ 2013-08-03 12:30:15
cinema1980: 金幣+50, 基金HEPI+1, ★★★★★最佳答案, 摘要已收到，謝謝！ 2013-08-03 12:30:15
| 轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點的識別及基因水平轉(zhuǎn)移的預(yù)測是目前生物學(xué)研究的核心問題。目前已有許多非比對統(tǒng)計方法來計算及用實驗的方法來解決這兩個問題。然而，在這些方法中，除過一些模擬研究以外，用統(tǒng)計值的統(tǒng)計功效方法來研究該問題尤其少，而統(tǒng)計分析的誤差將影響到所構(gòu)建演化樹的可靠性。本項目將在基于非比對D2統(tǒng)計值的基礎(chǔ)上展開以下研究。（1）建立背景序列為高階馬爾可夫過程的隱馬爾可夫模型；通過Bernoulli分布建立一種轉(zhuǎn)換模型來研究兩種情況下統(tǒng)計功效的分布情況，并通過模擬給出兩種理論結(jié)果和圖解。（2）開發(fā)適用于NGS 數(shù)據(jù)比較的非比對方法并研究其統(tǒng)計功效，期望有個近似統(tǒng)計極值，其統(tǒng)計功效在序列長度趨于無窮大時快速接近于1。（3）通過研究統(tǒng)計值與演化距離的關(guān)系，構(gòu)建演化樹。該研究在同源序列分析、基因水平轉(zhuǎn)移及系統(tǒng)演化樹構(gòu)造等領(lǐng)域具有一定的應(yīng)用價值，可為生物學(xué)物種分類提供可靠的理論依據(jù)。 |
2樓2013-08-03 10:24:43
ahwzc
木蟲 (著名寫手)
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3樓2013-08-03 10:25:11
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