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cinema1980木蟲 (著名寫手)
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[求助]
青基 11205061 基于新一代測(cè)序數(shù)據(jù)的非比對(duì)統(tǒng)計(jì)功效的研究 摘要
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ahwzc
木蟲 (著名寫手)
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- 專業(yè): 自身免疫性疾病
【答案】應(yīng)助回帖
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cinema1980: 金幣+50, 基金HEPI+1, ★★★★★最佳答案, 摘要已收到，謝謝！ 2013-08-03 12:30:15
cinema1980: 金幣+50, 基金HEPI+1, ★★★★★最佳答案, 摘要已收到，謝謝！ 2013-08-03 12:30:15
| 轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點(diǎn)的識(shí)別及基因水平轉(zhuǎn)移的預(yù)測(cè)是目前生物學(xué)研究的核心問(wèn)題。目前已有許多非比對(duì)統(tǒng)計(jì)方法來(lái)計(jì)算及用實(shí)驗(yàn)的方法來(lái)解決這兩個(gè)問(wèn)題。然而，在這些方法中，除過(guò)一些模擬研究以外，用統(tǒng)計(jì)值的統(tǒng)計(jì)功效方法來(lái)研究該問(wèn)題尤其少，而統(tǒng)計(jì)分析的誤差將影響到所構(gòu)建演化樹(shù)的可靠性。本項(xiàng)目將在基于非比對(duì)D2統(tǒng)計(jì)值的基礎(chǔ)上展開(kāi)以下研究。（1）建立背景序列為高階馬爾可夫過(guò)程的隱馬爾可夫模型；通過(guò)Bernoulli分布建立一種轉(zhuǎn)換模型來(lái)研究?jī)煞N情況下統(tǒng)計(jì)功效的分布情況，并通過(guò)模擬給出兩種理論結(jié)果和圖解。（2）開(kāi)發(fā)適用于NGS 數(shù)據(jù)比較的非比對(duì)方法并研究其統(tǒng)計(jì)功效，期望有個(gè)近似統(tǒng)計(jì)極值，其統(tǒng)計(jì)功效在序列長(zhǎng)度趨于無(wú)窮大時(shí)快速接近于1。（3）通過(guò)研究統(tǒng)計(jì)值與演化距離的關(guān)系，構(gòu)建演化樹(shù)。該研究在同源序列分析、基因水平轉(zhuǎn)移及系統(tǒng)演化樹(shù)構(gòu)造等領(lǐng)域具有一定的應(yīng)用價(jià)值，可為生物學(xué)物種分類提供可靠的理論依據(jù)。 |
2樓2013-08-03 10:24:43
ahwzc
木蟲 (著名寫手)
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【答案】應(yīng)助回帖
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基于新一代測(cè)序數(shù)據(jù)的非比對(duì)統(tǒng)計(jì)功效的研究 負(fù)責(zé)人：劉雪梅 參與人：黃曉東, 謝匯章, 張玉霞, 燕晶, 周穎 金額：22萬(wàn) 申請(qǐng)時(shí)間：2012 學(xué)科代碼：統(tǒng)計(jì)物理學(xué)與復(fù)雜系統(tǒng)(A050105) 項(xiàng)目批準(zhǔn)號(hào)：11205061 申請(qǐng)單位：華南理工大學(xué) 研究類型：基礎(chǔ)研究 關(guān)鍵詞：非比對(duì)方法;隱馬爾科夫模型;統(tǒng)計(jì)功效;模體 |
3樓2013-08-03 10:25:11
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