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chboit新蟲 (小有名氣)
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[交流]
求助目的基因全序列查詢！ 已有4人參與
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| 找了一天也找不到，目的基因是硫酸鹽還原菌的脫硫基因dsrB（dissimilatory sulfite reductase），想找到它的全序列來做質(zhì)粒合成，求幫助�。。。。�！Sample Text |
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小木蟲: 金幣+0.5, 給個紅包，謝謝回帖
gyesang: 金幣+5, good! 2013-08-07 16:00:05
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dissimilatory sulfite reductase [uncultured sulfate-reducing bacterium] GenBank: ABI97365.1 FASTA Graphics Go to: LOCUS ABI97365 250 aa linear ENV 13-NOV-2008 DEFINITION dissimilatory sulfite reductase, partial [uncultured sulfate-reducing bacterium]. ACCESSION ABI97365 VERSION ABI97365.1 GI:115432176 DBSOURCE accession DQ903925.1 KEYWORDS . SOURCE uncultured sulfate-reducing bacterium ORGANISM uncultured sulfate-reducing bacterium Bacteria; environmental samples. REFERENCE 1 (residues 1 to 250) AUTHORS Chi Fru,E. and Athar,R. TITLE In situ bacterial colonization of compacted bentonite under deep geological high-level radioactive waste repository conditions JOURNAL Appl. Microbiol. Biotechnol. 79 (3), 499-510 (2008) PUBMED 18379777 REFERENCE 2 (residues 1 to 250) AUTHORS Fru,E.C., Atha,R., O'Neill,A.H. and Pedersen,K. TITLE Comparative 16S rRNA and dissimilatory sulfite reductase (DSR) gene characterization of sulfate-reducing prokaryotes in a deep granitic environment JOURNAL Unpublished REFERENCE 3 (residues 1 to 250) AUTHORS Fru,E.C., Atha,R., O'Neill,A.H. and Pedersen,K. TITLE Direct Submission JOURNAL Submitted (16-AUG-2006) Cell and Molecular Biology, Microbiology, Gothenburg University, Box 462, Gothenburg 405 30, Sweden COMMENT Method: conceptual translation. FEATURES Location/Qualifiers source 1..250 /organism="uncultured sulfate-reducing bacterium" /isolation_source="granitic aquifer" /db_xref="taxon:153939" /clone="R4" /environmental_sample Protein <1..>250 /product="dissimilatory sulfite reductase" Region 1..>250 /region_name="dsrA" /note="sulfite reductase, dissimilatory-type alpha subunit; TIGR02064" /db_xref="CDD:211711" Region 16..74 /region_name="NIR_SIR_ferr" /note="Nitrite/Sulfite reductase ferredoxin-like half domain; pfam03460" /db_xref="CDD:202646" CDS 1..250 /gene="dsrA" /coded_by="DQ903925.1:<1..>753" /codon_start=3 /transl_table=11 ORIGIN 1 rfsdvpeqfp aaahfhtirv nqpsgwyytt dalrqlydiw dkygsgltnm hgstgdavfl 61 gagtdeledi fcelskaewd lggsgsdvrt pscclgpsrc efacydtlal tydltmtyqd 121 elhrpifpyk wkfkmagcpn dcvasiarsd fsiigtwrdd iridhdavte yaeagldikf 181 dvarrcptkc ikwdgtklei dnsecvrcmh cinvmpkalr pgtdtgatll igakapivqg 241 ailssvlvpf // Uncultured sulfate-reducing bacterium clone R4 dissimilatory sulfite reductase (dsrA) gene, partial cds GenBank: DQ903925.1 GenBank Graphics PopSet >gi|115432175|gb|DQ903925.1| Uncultured sulfate-reducing bacterium clone R4 dissimilatory sulfite reductase (dsrA) gene, partial cds GCCGGTTCTCGGATGTGCCGGAGCAATTTCCAGCAGCGGCCCATTTCCACACCATCCGTGTCAACCAGCC ATCAGGCTGGTATTACACCACTGATGCCTTAAGGCAGTTGTATGACATCTGGGACAAGTACGGCTCAGGC CTGACCAATATGCACGGCTCAACAGGTGATGCCGTATTCTTAGGCGCAGGCACCGATGAGTTAGAAGACA TCTTCTGCGAGCTTTCCAAAGCAGAATGGGATTTAGGCGGCTCAGGCTCGGATGTGCGCACTCCCAGTTG CTGCCTTGGTCCGTCCAGATGTGAATTTGCCTGCTACGACACCCTGGCCTTAACCTATGATTTGACCATG ACCTACCAGGACGAGCTGCACAGACCGATCTTTCCATACAAATGGAAGTTCAAGATGGCTGGCTGTCCAA ATGACTGCGTGGCCTCGATTGCCCGGTCTGATTTCTCTATCATTGGCACCTGGCGGGATGATATTCGTAT TGACCACGATGCGGTAACCGAATATGCCGAAGCCGGCCTGGACATCAAGTTTGATGTTGCCCGCAGATGC CCCACCAAGTGTATCAAATGGGATGGAACCAAGTTAGAGATTGACAACAGTGAGTGTGTCAGATGTATGC ACTGCATTAATGTCATGCCTAAAGCCCTTCGTCCGGGCACTGACACCGGAGCTACTCTCTTGATTGGAGC CAAGGCCCCCATTGTCCAGGGTGCAATTCTCTCTTCAGTCTTAGTGCCCTTTA |
2樓2013-08-07 13:36:39
mmz123250
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