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怎么利用chembio3D優(yōu)化自己畫的配體分子,求詳細(xì)步驟
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| 怎么利用chembio3D優(yōu)化自己畫的配體分子,得到pdb文件,求詳細(xì)步驟,thank you! |




金蟲 (小有名氣)
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我一般分兩步優(yōu)化: 1.先用分子力場MM2做簡單優(yōu)化(分子畫好后,點(diǎn)擊圖標(biāo)MM2,就是下面有黑色箭頭的一個) 2.優(yōu)化好后,再點(diǎn)calculations下面GAMESS interface下面Minimize,直接點(diǎn)Run即可。 3.查看電荷在calculations下面extended huckel下面calculate charges。 4.至于pdb文件,在保存時選擇保存為pdb的格式就可以了。 |

銅蟲 (正式寫手)
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