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[求助]
怎么利用chembio3D優(yōu)化自己畫的配體分子，求詳細(xì)步驟
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3樓2013-08-15 12:06:28
2樓2013-08-15 11:59:24
5樓2013-08-15 12:14:58
stevenchem
金蟲 (小有名氣)
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【答案】應(yīng)助回帖
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感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
watyu123: 金幣+10, ★★★★★最佳答案, 謝謝啦 2013-08-16 15:33:00
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watyu123: 金幣+10, ★★★★★最佳答案, 謝謝啦 2013-08-16 15:33:00
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我一般分兩步優(yōu)化： 1.先用分子力場(chǎng)MM2做簡(jiǎn)單優(yōu)化（分子畫好后，點(diǎn)擊圖標(biāo)MM2,就是下面有黑色箭頭的一個(gè)） 2.優(yōu)化好后，再點(diǎn)calculations下面GAMESS interface下面Minimize，直接點(diǎn)Run即可。 3.查看電荷在calculations下面extended huckel下面calculate charges。 4.至于pdb文件，在保存時(shí)選擇保存為pdb的格式就可以了。 |
6樓2013-08-16 12:41:08
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