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saabx銅蟲 (小有名氣)
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[求助]
amber 非正常殘基的制作
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在使用amber12制作非正常殘基中，非正常殘基在肽段的中間位置：ILE-XXX-LEU 計算出來的參數(shù)調(diào)入并且進行check，顯示都是正常，但是在保存pdb的時候，在XXX的后面出現(xiàn)TER ATOM 966 C12 XXX 63...... ATOM 967 H11 XXX 63...... TER ATOM 968 N LEU 64 .... ATOM 969 H LEU 64 .... 請問為什么會出現(xiàn)TER？我的考慮可能是因為沒有成鍵，故我用bond建立連接，輸出的結(jié)構(gòu)依然中間含有TER，求高人指點！ [ Last edited by saabx on 2013-9-13 at 15:11 ] |
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2樓2013-09-14 08:10:18
saabx
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3樓2013-09-14 12:38:09
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