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saabx銅蟲 (小有名氣)
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[求助]
amber 非正常殘基的制作
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在使用amber12制作非正常殘基中，非正常殘基在肽段的中間位置：ILE-XXX-LEU 計算出來的參數調入并且進行check，顯示都是正常，但是在保存pdb的時候，在XXX的后面出現TER ATOM 966 C12 XXX 63...... ATOM 967 H11 XXX 63...... TER ATOM 968 N LEU 64 .... ATOM 969 H LEU 64 .... 請問為什么會出現TER？我的考慮可能是因為沒有成鍵，故我用bond建立連接，輸出的結構依然中間含有TER，求高人指點！ [ Last edited by saabx on 2013-9-13 at 15:11 ] |
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saabx
銅蟲 (小有名氣)
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- 蟲號: 1271243
- 注冊: 2011-04-20
- 性別: GG
- 專業(yè): 理論和計算化學
3樓2013-09-14 12:38:09
2樓2013-09-14 08:10:18
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