 |
 |
 |
 |
 |
 |
||
 |
 |
 |
 |
 |
| 2 | 1/1 | 返回列表 |
| 查看: 407 | 回復(fù): 1 | |||||
[求助]
RDFs和preferential binding有什么區(qū)別
|
|
我用分子模擬方法計(jì)算水溶液中鹽離子和蛋白質(zhì)的相互作用，分析了不同離子相對(duì)蛋白質(zhì)特定位點(diǎn)的RDF，發(fā)現(xiàn)有的離子容易聚集在該位點(diǎn)，而有的離子疏遠(yuǎn)該位點(diǎn)。（從RDF的峰的分布得到）因此，我們說(shuō)容易聚集在該位點(diǎn)的離子就是preferential binding or interaction。 審稿意見(jiàn)中，審稿人說(shuō)“RDFs can not determine whether there is a preferential binding or not, however, it can indicate if there is accumulation (or an increase in density/probability) at the protein interface.” 所以我想知道，RDFs和preferential binding有什么區(qū)別？謝謝解答！剛做MD不久，基本概念不清楚，勿噴！ |
回復(fù)此樓» 猜你喜歡
求化學(xué)調(diào)劑
已經(jīng)有5人回復(fù)
-
085600，材料與化工321分求調(diào)劑
已經(jīng)有10人回復(fù)
-
求調(diào)劑
已經(jīng)有4人回復(fù)
-
0703 化學(xué) 求調(diào)劑，一志愿山東大學(xué) 342 分
已經(jīng)有5人回復(fù)
-
一志愿南開(kāi)大學(xué)0710生物學(xué)359求調(diào)劑
已經(jīng)有3人回復(fù)
-
085600，專業(yè)課化工原理，320分求調(diào)劑
已經(jīng)有4人回復(fù)
-
材料與化工272求調(diào)劑
已經(jīng)有16人回復(fù)
-
290求調(diào)劑
已經(jīng)有3人回復(fù)
-
327求調(diào)劑
已經(jīng)有3人回復(fù)
-
085600 286分 材料求調(diào)劑
已經(jīng)有11人回復(fù)
» 本主題相關(guān)商家推薦: (我也要在這里推廣)
pigrass
專家顧問(wèn) (著名寫(xiě)手)
伊卡斯特的小豬
-
專家經(jīng)驗(yàn): +503 - 模擬EPI: 4
- 應(yīng)助: 377 (碩士)
- 金幣: 10371
- 散金: 3286
- 紅花: 166
- 帖子: 2101
- 在線: 1968.4小時(shí)
- 蟲(chóng)號(hào): 1463681
- 注冊(cè): 2011-10-27
- 性別: GG
- 專業(yè): 高分子材料結(jié)構(gòu)與性能
- 管轄: 分子模擬
【答案】應(yīng)助回帖
★ ★
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
ben_ladeng: 金幣+2, 謝謝指教 2013-09-21 22:16:18
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
ben_ladeng: 金幣+2, 謝謝指教 2013-09-21 22:16:18
|
對(duì)蛋白質(zhì)方面不是很了解 RDF僅僅表示在附近分布 曾看過(guò)一篇文獻(xiàn)，用RDF來(lái)推測(cè)氫鍵是不是可能存在，但是僅有RDF不能說(shuō)明氫鍵必定存在，作者用紅外光譜計(jì)算能量最后才確定存在氫鍵 你這個(gè)問(wèn)題估計(jì)差不多，RDF僅僅是preferential binding的必要不充分條件。。。 或許要計(jì)算下binding energy？再找找相關(guān)文獻(xiàn)吧 |
2樓2013-09-21 20:07:47
相關(guān)版塊跳轉(zhuǎn)
我要訂閱樓主 mengsk 的主題更新
| 2 | 1/1 | 返回列表 |
| 最具人氣熱帖推薦 [查看全部] | 作者 | 回/看 | 最后發(fā)表 | |
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 290求調(diào)劑 +3 | dfffsar 2026-03-29 | 3/150 |
|
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 化學(xué)0703 調(diào)劑 306分 一志愿211 +7 | 26要上岸 2026-03-28 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 332求調(diào)劑 +8 | 蕉蕉123 2026-03-28 | 8/400 |
|
|
|
[考研] 348求調(diào)劑 +5 | 小懶蟲(chóng)不懶了 2026-03-28 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 一志愿太原理工安全工程300分，求調(diào)劑 +5 | 0857求調(diào)劑. 2026-03-24 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 食品工程專碩一志愿中海洋309求調(diào)劑 +4 | 小張zxy張 2026-03-26 | 8/400 |
|
|
|
[考研] 一志愿華北電力大學(xué)能動(dòng)專碩，293，求調(diào)劑 +3 | 15537177284 2026-03-23 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 一志愿南昌大學(xué)324求調(diào)劑 +7 | hanamiko 2026-03-27 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 291求調(diào)劑 +6 | HanBeiNingZC 2026-03-24 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 279 分 求調(diào)劑 +4 | 睡個(gè)好覺(jué)_16 2026-03-24 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 一志愿吉大071010，316分求調(diào)劑 +3 | xgbiknn 2026-03-27 | 3/150 |
|
|
|
[考研]
 085602化學(xué)工程求調(diào)劑。
+4
|
平樂(lè)樂(lè)樂(lè) 2026-03-26 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 機(jī)械學(xué)碩310分，數(shù)一英一，一志愿211本科雙非找調(diào)劑信息 +3 | @357 2026-03-25 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 081700 調(diào)劑 267分 +11 | 迷人的哈哈 2026-03-23 | 11/550 |
|
|
|
[考研] 309求調(diào)劑 +4 | gajsj 2026-03-25 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 機(jī)械學(xué)碩總分317求調(diào)劑�。。�！ +4 | Acaciad 2026-03-25 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 材料專碩 335 分求調(diào)劑 +4 | 拒絕冷暴力 2026-03-25 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 293求調(diào)劑 +7 | 加一一九 2026-03-24 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 333求調(diào)劑 +3 | ALULU4408 2026-03-23 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 接收2026碩士調(diào)劑(學(xué)碩+專碩) +4 | allen-yin 2026-03-23 | 6/300 |
|