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聰明的傻帽兒木蟲 (小有名氣)
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[交流]
啟動子順式調(diào)控元件圖譜構(gòu)建 已有3人參與
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| 怎么構(gòu)建順式調(diào)控元件圖譜？是要一個一個把調(diào)控元件找出來進行標記嗎？用什么方法找？ |
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 核酸生物學(xué)實驗經(jīng)驗 |
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2樓2013-10-05 09:56:16
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3樓2013-10-05 10:37:02
baby1987
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4樓2013-10-05 11:32:20
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8樓2013-10-19 12:33:15
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順式元件必須要與反式因子相互作用才能發(fā)揮作用，這樣也就是在研究DNA-Protein相互作用的問題，你用ChIP，足跡法等DNA-Protein相互作用都可以呀，提取到DNA-Protein complex（用凝膠阻滯電泳和親和層析都可以）去掉蛋白質(zhì)保護之外的DNA片段，對剩下的DNA片段測序。如果剩下的DNA片段測序有修飾則用質(zhì)譜測序，沒有修飾就用一般的酶法或者化學(xué)法為基礎(chǔ)的自動測序儀測序，當(dāng)不知道有沒有核酸修飾時先用一般的酶法或者化學(xué)法為基礎(chǔ)的自動測序儀測序，有修飾的位點測不出來（信號無法識別），但是不影響其他位點的確定。 但是順式元件的最少序列可不一定就是DNA-Protein complex中受到蛋白質(zhì)保護的DNA片段，所以先做細胞外實驗，截斷DNA-Protein complex中受到蛋白質(zhì)保護外的DNA片段至鄰近被保護的序列，看看DNA-Protein complex是否能夠形成，結(jié)合軟件預(yù)測。 |
9樓2013-10-19 13:17:45
凌波麗
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10樓2013-10-19 14:22:03
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