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聰明的傻帽兒木蟲(chóng) (小有名氣)
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[交流]
啟動(dòng)子順式調(diào)控元件圖譜構(gòu)建 已有3人參與
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| 怎么構(gòu)建順式調(diào)控元件圖譜？是要一個(gè)一個(gè)把調(diào)控元件找出來(lái)進(jìn)行標(biāo)記嗎？用什么方法找？ |
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凌波麗
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小木蟲(chóng): 金幣+0.5, 給個(gè)紅包，謝謝回帖
小木蟲(chóng): 金幣+0.5, 給個(gè)紅包，謝謝回帖
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順式元件必須要與反式因子相互作用才能發(fā)揮作用，這樣也就是在研究DNA-Protein相互作用的問(wèn)題，你用ChIP，足跡法等DNA-Protein相互作用都可以呀，提取到DNA-Protein complex（用凝膠阻滯電泳和親和層析都可以）去掉蛋白質(zhì)保護(hù)之外的DNA片段，對(duì)剩下的DNA片段測(cè)序。如果剩下的DNA片段測(cè)序有修飾則用質(zhì)譜測(cè)序，沒(méi)有修飾就用一般的酶法或者化學(xué)法為基礎(chǔ)的自動(dòng)測(cè)序儀測(cè)序，當(dāng)不知道有沒(méi)有核酸修飾時(shí)先用一般的酶法或者化學(xué)法為基礎(chǔ)的自動(dòng)測(cè)序儀測(cè)序，有修飾的位點(diǎn)測(cè)不出來(lái)（信號(hào)無(wú)法識(shí)別），但是不影響其他位點(diǎn)的確定。 但是順式元件的最少序列可不一定就是DNA-Protein complex中受到蛋白質(zhì)保護(hù)的DNA片段，所以先做細(xì)胞外實(shí)驗(yàn)，截?cái)郉NA-Protein complex中受到蛋白質(zhì)保護(hù)外的DNA片段至鄰近被保護(hù)的序列，看看DNA-Protein complex是否能夠形成，結(jié)合軟件預(yù)測(cè)。 |
9樓2013-10-19 13:17:45
baby1987
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2樓2013-10-05 09:56:16
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3樓2013-10-05 10:37:02
baby1987
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4樓2013-10-05 11:32:20
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