 |
 |
 |
 |
 |
 |
||
 |
 |
 |
 |
 |
| 5 | 1/1 | 返回列表 |
| 查看: 2212 | 回復(fù): 15 | ||
| 當(dāng)前只顯示滿足指定條件的回帖，點(diǎn)擊這里查看本話題的所有回帖 | ||
therotyonth金蟲 (正式寫手)
|
[求助]
Gaussian 09 處理后的文件始終無法在AMBER中的antechamber命令中完成
|
|
|
輸入文件flu.com --Link1-- %chk=molecule #HF/6-31G* SCF=tight Test Pop=MK iop(6/33=2) iop(6/42=6) opt iop(6/50=1) remark line goes here 0 1 …………………… PBS文件 #!/bin/bash # #PBS -l nodes=1:ppn=12 #PBS -l walltime=1444:00:00 #PBS -V cd $PBS_O_WORKDIR export g09root=/share/apps/software source $g09root/g09/bsd/g09.profile export GAUSS_SCRDIR=/state/partition1 date g09 /home/flu.com date 處理后的文件flu.log用以下命令 antechamber -i flu.log -fi gout -o flu.prepi -fo prepi -c resp -s 2 提示： Running: /usr/local/amber12/bin/bondtype -j full -i ANTECHAMBER_BOND_TYPE.AC0 -o ANTECHAMBER_BOND_TYPE.AC -f ac Running: /usr/local/amber12/bin/atomtype -i ANTECHAMBER_AC.AC0 -o ANTECHAMBER_AC.AC -p gaff Running: /usr/local/amber12/bin/espgen -o ANTECHAMBER.ESP -i flu.log espgen cannot deal with Gaussian 09 log file, please generate Gaussian 09 ESP file using iop(6/50=1) and rerun espgen Error: cannot run "/usr/local/amber12/bin/espgen -o ANTECHAMBER.ESP -i flu.log" in resp() of charge.c properly, exit 這個(gè)是怎么回事呀？ 剛剛接觸計(jì)算，望各位大俠能幫幫茫茫哈！ |
回復(fù)此樓» 猜你喜歡
基金正文30頁指的是報(bào)告正文還是整個(gè)申請書
已經(jīng)有9人回復(fù)
-
哈爾濱工業(yè)大學(xué)（深圳）綠色化學(xué)團(tuán)隊(duì)招收2026年秋季入學(xué)博士生
已經(jīng)有11人回復(fù)
-
物理化學(xué)論文潤色/翻譯怎么收費(fèi)?
已經(jīng)有107人回復(fù)
-
澳大利亞昆士蘭科技大學(xué)PhD博士獎(jiǎng)學(xué)金
已經(jīng)有0人回復(fù)
-
【211博士招生】環(huán)境化學(xué)、地學(xué)、毒理方向，擅長污染物遷移轉(zhuǎn)化降解、計(jì)算模擬者優(yōu)先
已經(jīng)有17人回復(fù)
-
求助如何利用vasp計(jì)算磁光克爾效應(yīng)
已經(jīng)有1人回復(fù)
-
070300總分298求調(diào)劑
已經(jīng)有2人回復(fù)
-
一志愿廈門大學(xué)化學(xué)學(xué)碩307求調(diào)劑
已經(jīng)有13人回復(fù)
-
理論與計(jì)算化學(xué)方向調(diào)劑——初試388分（數(shù)學(xué)144）
已經(jīng)有0人回復(fù)
-
招生材料與化工、環(huán)境科學(xué)調(diào)劑研究生
已經(jīng)有5人回復(fù)
» 本主題相關(guān)價(jià)值貼推薦，對您同樣有幫助:
- Amber tools 中的antechamber 必須要在安裝了amber11的前體下才能使用么?
已經(jīng)有4人回復(fù)
- 【火大】Gaussian的Cubegen命令中Laplacian選項(xiàng)是bug。原因找到了
已經(jīng)有3人回復(fù)
- 【轉(zhuǎn)帖】用Amber+Gaussian做小分子力場
已經(jīng)有16人回復(fù)
therotyonth
金蟲 (正式寫手)
- 應(yīng)助: 9 (幼兒園)
- 金幣: 2835.4
- 紅花: 11
- 帖子: 955
- 在線: 68.9小時(shí)
- 蟲號: 2349854
- 注冊: 2013-03-15
- 專業(yè): 理論和計(jì)算化學(xué)
4樓2013-10-07 09:06:22
therotyonth
金蟲 (正式寫手)
- 應(yīng)助: 9 (幼兒園)
- 金幣: 2835.4
- 紅花: 11
- 帖子: 955
- 在線: 68.9小時(shí)
- 蟲號: 2349854
- 注冊: 2013-03-15
- 專業(yè): 理論和計(jì)算化學(xué)
2樓2013-10-06 22:01:58
lishijunzong
鐵桿木蟲 (正式寫手)
- 應(yīng)助: 214 (大學(xué)生)
- 金幣: 5034
- 紅花: 10
- 帖子: 574
- 在線: 195.1小時(shí)
- 蟲號: 1121020
- 注冊: 2010-10-13
- 性別: GG
- 專業(yè): 理論和計(jì)算化學(xué)
3樓2013-10-07 08:32:30
therotyonth
金蟲 (正式寫手)
- 應(yīng)助: 9 (幼兒園)
- 金幣: 2835.4
- 紅花: 11
- 帖子: 955
- 在線: 68.9小時(shí)
- 蟲號: 2349854
- 注冊: 2013-03-15
- 專業(yè): 理論和計(jì)算化學(xué)
5樓2013-10-07 09:08:48
| 最具人氣熱帖推薦 [查看全部] | 作者 | 回/看 | 最后發(fā)表 | |
|---|---|---|---|---|
|
[基金申請]
請問共同通訊和共同一作的認(rèn)可度問題
 30+3
|
psa1234 2026-04-01 | 3/150 |
|
|---|---|---|---|---|
|
|
[考研] 一志愿南昌大學(xué)324求調(diào)劑 +11 | hanamiko 2026-04-01 | 11/550 |
|
|
[考研] 070300化學(xué)279求調(diào)劑 +15 | 哈哈哈^_^ 2026-03-31 | 17/850 |
|
|
|
[考研] 320分，材料與化工專業(yè)，求調(diào)劑 +14 | 一定上岸aaa 2026-03-27 | 18/900 |
|
|
|
[考研] 070300求調(diào)劑306分 +5 | 26要上岸 2026-03-27 | 5/250 |
|
|
|
[碩博家園] 博一被送出聯(lián)培感覺不適應(yīng)怎么辦 +3 | 全村的狗 2026-03-31 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 0855機(jī)械初試280求調(diào)劑 +3 | kazenotori 2026-03-31 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 一志愿北京科技大學(xué)材料學(xué)碩328分求調(diào)劑 +4 | 1段時(shí)間 2026-03-31 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 材料工程085601數(shù)二英一335求調(diào)劑 +5 | 雙馬尾痞老板2 2026-03-31 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 315求調(diào)劑 +6 | akie... 2026-03-28 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 本科211生物醫(yī)學(xué)工程085409求調(diào)劑339分 +7 | 里子木yy 2026-03-29 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 一志愿西電085401數(shù)一英一299求調(diào)劑 六級521 +4 | 愛吃大鴨梨 2026-03-31 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 269求調(diào)劑 +4 | 我想讀研11 2026-03-31 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 一志愿華中師范化學(xué)332分求調(diào)劑 +3 | Lyy930824@ 2026-03-29 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 327求調(diào)劑 +5 | 小卡不卡. 2026-03-29 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 332求調(diào)劑 +6 | @MZB382400 2026-03-28 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 一志愿中南大學(xué)化學(xué)0703總分337求調(diào)劑 +6 | niko- 2026-03-27 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 316求調(diào)劑 +7 | 江辭666 2026-03-26 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 352分 化工與材料 +5 | 海納百川Ly 2026-03-27 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 298調(diào)劑 +3 | jiyingjie123 2026-03-27 | 3/150 |
|