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piscesee鐵桿木蟲 (正式寫手)
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[求助]
做虛擬篩選判斷一個化合物好壞的標(biāo)準(zhǔn)是什么
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各位，做虛擬篩選時怎么判斷一個小分子化合物是篩選得到的有可能合理的化合物，單從binding energy就可以么，個人覺得由于分子結(jié)構(gòu)差別很大，不同分子含有的原子個數(shù)差別很大，看最后得到的總的binding energy不能反應(yīng)問題啊。。。 我試了下，將已經(jīng)上市的原子數(shù)較少的藥物分子跟一個比它原子數(shù)多的隨機的新化合物比較，對接后這個藥物分子的binding energy絕對值反而會比新化合物小啊，這是怎么回事，應(yīng)該不是操作問題。難道這個新化合物會有更好的活性，我覺得不太可能。。。 所以虛擬篩選怎么去判斷該合成哪些化合物來提高成功率呢。。。 |
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yaozhq
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7樓2013-10-17 18:25:04
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