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piscesee鐵桿木蟲 (正式寫手)
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[求助]
做虛擬篩選判斷一個(gè)化合物好壞的標(biāo)準(zhǔn)是什么
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各位，做虛擬篩選時(shí)怎么判斷一個(gè)小分子化合物是篩選得到的有可能合理的化合物，單從binding energy就可以么，個(gè)人覺(jué)得由于分子結(jié)構(gòu)差別很大，不同分子含有的原子個(gè)數(shù)差別很大，看最后得到的總的binding energy不能反應(yīng)問(wèn)題啊。。。 我試了下，將已經(jīng)上市的原子數(shù)較少的藥物分子跟一個(gè)比它原子數(shù)多的隨機(jī)的新化合物比較，對(duì)接后這個(gè)藥物分子的binding energy絕對(duì)值反而會(huì)比新化合物小啊，這是怎么回事，應(yīng)該不是操作問(wèn)題。難道這個(gè)新化合物會(huì)有更好的活性，我覺(jué)得不太可能。。。 所以虛擬篩選怎么去判斷該合成哪些化合物來(lái)提高成功率呢。。。 |
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piscesee
鐵桿木蟲 (正式寫手)
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3樓2013-10-15 16:39:29
yaozhq
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4樓2013-10-16 10:04:00
huyingdamon 
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5樓2013-10-17 16:36:59
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