 |
 |
 |
 |
 |
 |
||
 |
 |
 |
 |
 |
| 8 | 1/1 | 返回列表 |
| 查看: 2148 | 回復: 7 | |||
junjun0711新蟲 (小有名氣)
|
[求助]
請教關(guān)于AUTODOCK做虛i擬篩選的問題
|
| 我是做藥理的，由于課題需要我想用AUTODOCK虛擬篩選下中藥的活性，是中藥的小分子物質(zhì)和蛋白靶點的對接，因為實驗條件太有限，我才選了免費的AUTODOCK,自學了一個月吧，之前也沒什么了解，現(xiàn)在有同學和我說用AUTODOCK會不準，建議不用，哪位高手能給我解答一下，小妹感激不盡。 |
回復此樓» 猜你喜歡
深圳大學碩士招生（2026秋，傳感器方向，僅錄取第一志愿）
已經(jīng)有10人回復
-
278求調(diào)劑
已經(jīng)有5人回復
-
化學工程321分求調(diào)劑
已經(jīng)有15人回復
-
材料專碩306英一數(shù)二
已經(jīng)有11人回復
-
334求調(diào)劑
已經(jīng)有3人回復
-
268求調(diào)劑
已經(jīng)有5人回復
-
293求調(diào)劑
已經(jīng)有16人回復
-
302求調(diào)劑
已經(jīng)有7人回復
-
312求調(diào)劑
已經(jīng)有6人回復
-
281求調(diào)劑（0805）
已經(jīng)有9人回復
» 本主題相關(guān)商家推薦: (我也要在這里推廣)
» 本主題相關(guān)價值貼推薦，對您同樣有幫助:
- AutoDock安裝問題
已經(jīng)有5人回復
- autodock 模擬結(jié)果不對
已經(jīng)有5人回復
- Autodock 參數(shù)設(shè)定問題
已經(jīng)有3人回復
- 請教各位大神關(guān)于軟件版權(quán)的問題~~~~~
已經(jīng)有7人回復
- autodock對接時蛋白的處理問題
已經(jīng)有6人回復
- Autodock中受體的準備
已經(jīng)有14人回復
- 有關(guān)Autodock結(jié)果分析中結(jié)合自由能的問題
已經(jīng)有6人回復
- Autodock的操作流程---win下
已經(jīng)有565人回復
- autodock安裝好后導入分子為什么不對（附圖）
已經(jīng)有18人回復
- AutoDock產(chǎn)生的結(jié)果dlg文件轉(zhuǎn)化成pdb文件
已經(jīng)有13人回復
- AutoDock參數(shù)設(shè)置問題
已經(jīng)有6人回復
- 用AutoDock作分子對接前的小分子能量最小化問題
已經(jīng)有6人回復
- 【分享】RocketDock_ Leopard 3D模擬【已搜索無重復】
已經(jīng)有15人回復
- 【求助】Autodock用于虛擬篩選
已經(jīng)有21人回復
- 【討論】autodock運行時間過長
已經(jīng)有12人回復
- 【求助】autodock結(jié)果怎么分析 還有怎么來進行篩選
已經(jīng)有12人回復
- 【求助】關(guān)于Autodock中Grid中的問題
已經(jīng)有9人回復
- 【在線答疑】UCSF DOCK分子對接和虛擬篩選
已經(jīng)有42人回復
- 【資源】PyRx-基于autodock的虛擬篩選軟件
已經(jīng)有31人回復
- 【原創(chuàng)】AutoDock使用筆記總結(jié)－原創(chuàng)始發(fā)
已經(jīng)有32人回復
【答案】應助回帖
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感謝參與，應助指數(shù) +1
junjun0711: 金幣+8 2013-10-18 16:15:59
感謝參與，應助指數(shù) +1
junjun0711: 金幣+8 2013-10-18 16:15:59
|
小妹，“會不準”這個是必然的：）不能因為會不準，你就不去做了！因為科學研究本來就“會不準”，是允許失敗和錯誤產(chǎn)生的。 在做對接的時候，為了提高準確率應該提前做一些工作： 1、了解蛋白結(jié)構(gòu)，選擇合適的蛋白pdb。 2、把已知的蛋白抑制劑用來做對接，研究其可能的構(gòu)效關(guān)系。 ................ 當然，對于對接結(jié)果的分析也是很重要的，具體的可以看這個帖子： 《關(guān)于對接結(jié)果評估的問題》http://bioms.org/thread-841-1-1.html |
2樓2013-10-18 15:36:14
junjun0711
新蟲 (小有名氣)
- 應助: 4 (幼兒園)
- 金幣: 312
- 散金: 100
- 帖子: 75
- 在線: 135.9小時
- 蟲號: 2002913
- 注冊: 2012-09-15
- 專業(yè): 皮膚及其附屬器疾病其他科
3樓2013-10-18 15:52:14
【答案】應助回帖
|
1、首先，你有個誤區(qū)：學術(shù)免費軟件不如商業(yè)軟件準確。 對于這點，我想說：這是完全錯誤的！很多商業(yè)軟件都是由學術(shù)軟件轉(zhuǎn)變過來的，它們只是做得更簡單，讓用戶更容易使用！比如DS中的蛋白同源模建，使用的是學術(shù)免費軟件Modeller，Schrodinger中的分子動力學，則是使用的學術(shù)免費軟件Desmond。 想反，對于Autodock的精度來說，從眾多的文章可以看出，好于DS和sybyl的分子對接軟件！ 2、當然，你可以使用不同的對接軟件和打分函數(shù)來評價下你的分子，“兼聽則明”。 |
4樓2013-10-18 16:00:08
junjun0711
新蟲 (小有名氣)
- 應助: 4 (幼兒園)
- 金幣: 312
- 散金: 100
- 帖子: 75
- 在線: 135.9小時
- 蟲號: 2002913
- 注冊: 2012-09-15
- 專業(yè): 皮膚及其附屬器疾病其他科
5樓2013-10-18 16:01:51
junjun0711
新蟲 (小有名氣)
- 應助: 4 (幼兒園)
- 金幣: 312
- 散金: 100
- 帖子: 75
- 在線: 135.9小時
- 蟲號: 2002913
- 注冊: 2012-09-15
- 專業(yè): 皮膚及其附屬器疾病其他科
6樓2013-10-18 16:04:43
7樓2013-10-18 16:13:00
8樓2016-01-06 15:52:29
相關(guān)版塊跳轉(zhuǎn)
我要訂閱樓主 junjun0711 的主題更新
| 8 | 1/1 | 返回列表 |
| 最具人氣熱帖推薦 [查看全部] | 作者 | 回/看 | 最后發(fā)表 | |
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 312求調(diào)劑 +5 | 陌宸希 2026-03-16 | 6/300 |
|
|---|---|---|---|---|
|
|
[考研] 311求調(diào)劑 +9 | 冬十三 2026-03-15 | 10/500 |
|
|
|
[考研] 290求調(diào)劑 +3 | p asserby. 2026-03-15 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 211本，11408一志愿中科院277分，曾在中科院自動化所實習 +6 | Losir 2026-03-12 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 材料與化工304求B區(qū)調(diào)劑 +7 | 邱gl 2026-03-11 | 8/400 |
|
|
|
[考研] 東南大學364求調(diào)劑 +5 | JasonYuiui 2026-03-15 | 5/250 |
|
|
|
[基金申請]
今年的國基金是打分制嗎？
 50+3
|
zhanghaozhu 2026-03-14 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 0703化學調(diào)劑 290分有科研經(jīng)歷，論文在投 +7 | 膩膩gk 2026-03-14 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 294求調(diào)劑 +3 | Zys010410@ 2026-03-13 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 297一志愿上交085600求調(diào)劑 +5 | 指尖八千里 2026-03-14 | 5/250 |
|
|
[考研] 304求調(diào)劑 +6 | Mochaaaa 2026-03-12 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 308求調(diào)劑 +5 | 是Lupa啊 2026-03-11 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 求材料調(diào)劑 085600英一數(shù)二總分302 前三科235 精通機器學習 一志愿哈工大 +4 | 林yaxin 2026-03-12 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 0856材料與化工301求調(diào)劑 +5 | 奕束光 2026-03-13 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 26調(diào)劑/材料/英一數(shù)二/總分289/已過A區(qū)線 +6 | 步川酷紫123 2026-03-13 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 290求調(diào)劑 +9 | ADT 2026-03-11 | 9/450 |
|
|
|
[考研] 四川大學085601材料工程專碩 初試294求調(diào)劑 +4 | 祝我們好在冬天 2026-03-11 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 材料專碩350 求調(diào)劑 +4 | 王金科 2026-03-12 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 工科材料085601 279求調(diào)劑 +8 | 困于星晨 2026-03-12 | 10/500 |
|
|
|
[考研] 321求調(diào)劑（食品/專碩） +3 | xc321 2026-03-12 | 6/300 |
|