 |
 |
 |
 |
 |
 |
||
 |
 |
 |
 |
 |
| 8 | 1/1 | 返回列表 |
| 查看: 2494 | 回復(fù): 7 | ||||
tianti_121新蟲 (小有名氣)
|
[交流]
怎樣分析基因組序列？ 已有7人參與
|
| 我們實(shí)驗(yàn)室對(duì)一株菌進(jìn)行了全基因組測(cè)序，現(xiàn)在全部序列已知，我想知道如何分析，看看里面都有些什么基因，從中找出適合下部試驗(yàn)的目的基因 |
回復(fù)此樓» 收錄本帖的淘帖專輯推薦
 生物信息學(xué) |
» 猜你喜歡
288資源與環(huán)境專碩求調(diào)劑，不限專業(yè)，有學(xué)上就行
已經(jīng)有6人回復(fù)
-
生物學(xué)學(xué)碩，一志愿湖南大學(xué)，初試成績(jī)338
已經(jīng)有8人回復(fù)
-
266分，求材料相關(guān)專業(yè)調(diào)劑
已經(jīng)有6人回復(fù)
-
304材料求調(diào)劑
已經(jīng)有5人回復(fù)
-
359求調(diào)劑
已經(jīng)有5人回復(fù)
-
085600 286分 材料求調(diào)劑
已經(jīng)有12人回復(fù)
-
各位老師好，我的一志愿為北京科技大學(xué)085601材料專碩
已經(jīng)有10人回復(fù)
-
一志愿：西北大學(xué)，英一數(shù)一408-284分求調(diào)劑
已經(jīng)有5人回復(fù)
-
291求調(diào)劑
已經(jīng)有10人回復(fù)
-
一志愿鄭州大學(xué)，080500學(xué)碩，總分317分求調(diào)劑
已經(jīng)有11人回復(fù)
» 本主題相關(guān)價(jià)值貼推薦，對(duì)您同樣有幫助:
- 水稻基因組序列對(duì)所用品種水稻通用么？
已經(jīng)有5人回復(fù)
- 在NCBI里搜索到a基因多條序列，如何確定該基因的序列？
已經(jīng)有9人回復(fù)
- 如何進(jìn)行基因中外顯子和內(nèi)含子的分析
已經(jīng)有11人回復(fù)
- 怎樣從MEGA5.0做出的系統(tǒng)進(jìn)化圖中找到各種基因的序列？
已經(jīng)有4人回復(fù)
- 怎么做基于KEGG的生物通路富集分析？
已經(jīng)有9人回復(fù)
- 如何獲得基因組序列
已經(jīng)有5人回復(fù)
- 如何查找一個(gè)蛋白DNA結(jié)合域的基因序列？
已經(jīng)有4人回復(fù)
- 如何用一直的一小段EST得到基因全長(zhǎng)，求高手指教~
已經(jīng)有7人回復(fù)
- 基因序列怎樣轉(zhuǎn)成核苷酸序列
已經(jīng)有7人回復(fù)
- 怎樣在NCBI中查找一物種的全基因組？
已經(jīng)有12人回復(fù)
- 序列相似度較低，該如何申請(qǐng)獲得基因登陸號(hào)
已經(jīng)有4人回復(fù)
- 基因如何分析？
已經(jīng)有7人回復(fù)
- 【求助/交流】基因序列的分析
已經(jīng)有5人回復(fù)
- 【求助/交流】如何提取基因組序列并分析,有什么軟件?
已經(jīng)有4人回復(fù)
- 【求助/交流】怎樣查找已知基因序列的等電點(diǎn)
已經(jīng)有5人回復(fù)
- 【求助/交流】已知基因序列如何克隆獲得
已經(jīng)有18人回復(fù)
qingarmy
金蟲 (正式寫手)
- 應(yīng)助: 19 (小學(xué)生)
- 金幣: 1353.3
- 散金: 222
- 紅花: 4
- 帖子: 890
- 在線: 318.9小時(shí)
- 蟲號(hào): 2612192
- 注冊(cè): 2013-08-23
- 專業(yè): 生物信息學(xué)
2樓2013-10-25 10:59:14
yechao0911
木蟲 (正式寫手)
- 應(yīng)助: 6 (幼兒園)
- 金幣: 4925.5
- 散金: 590
- 紅花: 8
- 帖子: 395
- 在線: 112.4小時(shí)
- 蟲號(hào): 1817216
- 注冊(cè): 2012-05-14
- 性別: GG
- 專業(yè): 系統(tǒng)生物學(xué)
3樓2013-10-25 23:01:26
恨月移魂
鐵蟲 (初入文壇)
- 應(yīng)助: 2 (幼兒園)
- 金幣: 204.5
- 散金: 40
- 帖子: 49
- 在線: 249.3小時(shí)
- 蟲號(hào): 2456616
- 注冊(cè): 2013-05-09
- 性別: GG
- 專業(yè): 微生物資源與分類學(xué)
4樓2013-10-27 23:17:43
xuyisit
木蟲 (著名寫手)
- 應(yīng)助: 17 (小學(xué)生)
- 金幣: 2308.3
- 散金: 1019
- 紅花: 2
- 帖子: 1433
- 在線: 201.6小時(shí)
- 蟲號(hào): 1187599
- 注冊(cè): 2011-01-11
- 性別: GG
- 專業(yè): 化學(xué)生物學(xué)與生物有機(jī)化學(xué)
5樓2013-11-10 17:22:38
笨熊zhou
木蟲 (小有名氣)
- 應(yīng)助: 9 (幼兒園)
- 金幣: 1813.4
- 紅花: 2
- 帖子: 133
- 在線: 17.1小時(shí)
- 蟲號(hào): 1500951
- 注冊(cè): 2011-11-20
- 性別: MM
- 專業(yè): 獸醫(yī)傳染病學(xué)
用PRIMER5或者DNAMAN，試試， 6樓2013-11-10 19:30:49
7樓2013-11-11 07:13:43
凌波麗
專家顧問(wèn) (知名作家)
-
專家經(jīng)驗(yàn): +218 - 應(yīng)助: 397 (碩士)
- 貴賓: 0.044
- 金幣: 2118.9
- 散金: 10
- 紅花: 208
- 帖子: 5633
- 在線: 571.6小時(shí)
- 蟲號(hào): 1766465
- 注冊(cè): 2012-04-19
- 性別: MM
- 專業(yè): 生物大分子結(jié)構(gòu)與功能
- 管轄: 生物科學(xué)綜合
★
小木蟲: 金幣+0.5, 給個(gè)紅包，謝謝回帖
小木蟲: 金幣+0.5, 給個(gè)紅包，謝謝回帖
|
實(shí)際上預(yù)測(cè)真核基因的結(jié)構(gòu)有很多種預(yù)測(cè)方法和免費(fèi)的網(wǎng)站。 具體請(qǐng)參見： 薛慶中 等編著，DNA和蛋白質(zhì)序列數(shù)據(jù)分析工具，科學(xué)出版社，2012，第三版，25-39，第2章 真核基因結(jié)構(gòu)的預(yù)測(cè)，其中有GENSCAN（針對(duì)基因組ＤＮＡ序列預(yù)測(cè)可讀框和基因結(jié)構(gòu)）: http://genes.mit.edu/GENSCAN.html 的操作介紹，還有CpGplot（CpG島預(yù)測(cè)）: http://www.ebi.ac.uk/emboss/cpgplot/index.html ,PromoterScan（啟動(dòng)子區(qū)域i預(yù)測(cè)）: http://www-bimas.cit.nih.gov/molbio/proscan 的介紹。也介紹了 用軟件CodonW 計(jì)算基因密碼子偏好性，CodonW 能夠在Windows系統(tǒng)下運(yùn)行，可以從http://codonw.sourcerforge.net 下載。 基因功能分類可以用Gene Ontology : http://www.geneontology.org 進(jìn)入界面后在基因功能數(shù)據(jù)庫(kù)中搜索目的基因可能的生物學(xué)功能，或者特定的生物學(xué)功能有哪些基因可能參與。還可以到 Genecards 數(shù)據(jù)庫(kù)去查詢 感興趣的基因的功能，Genecards http://www.genecards.org . 生物信息學(xué)參考書： 1.DNA和蛋白質(zhì)序列數(shù)據(jù)分析工具(第二版)PDF http://www.gaoyang168.com/bbs/viewthread.php?tid=6358121&fpage=1&target=blank 下載后即可閱讀。 2.DNA和蛋白質(zhì)序列數(shù)據(jù)分析工具_(dá)(第三版） http://www.gaoyang168.com/bbs/viewthread.php?tid=7614763&fpage=1&target=blank 下載后好像無(wú)法解壓，樓主試試看吧，至少“DNA和蛋白質(zhì)序列數(shù)據(jù)分析工具(第二版)”肯定能夠用。 “DNA和蛋白質(zhì)序列數(shù)據(jù)分析工具(第二版)”都是講的生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)和生物信息學(xué)軟件的具體應(yīng)用，很容易看懂并且自己上手操作，不過(guò)沒有講述各種算法的原理。 如果要更深入學(xué)習(xí)生物信息學(xué)，建議學(xué)習(xí)： 1.Pierre Baldi etal.,Bioinformatics------the Machine Learning Approach,MIT press,2001,千萬(wàn)不要看該書的翻譯版本，翻譯版爛的難以想象，翻譯版就連條件概率的公式的含義都不知道怎么解釋！下載：http://www.gaoyang168.com/bbs/viewthread.php?tid=1038227&fpage=1&target=blank 2.M.Zvelebil ,J.O.Baum 著（2008），李亦學(xué)、郝沛 主譯，理解生物信息學(xué)，科學(xué)出版社，2012，這本書的英文原版，我還沒有見過(guò)，此書內(nèi)容豐富，解析詳細(xì)，但是讓人非常不爽的是全書所有的數(shù)據(jù)庫(kù)和軟件下載處均未在正文中給出具體網(wǎng)址，而是每章末的參考文獻(xiàn)中給出帶有具體網(wǎng)址的SCI文獻(xiàn)。 3.李霞、李亦學(xué) 主編，生物信息學(xué)學(xué)習(xí)指導(dǎo)與習(xí)題集，人民衛(wèi)生出版社，2011，現(xiàn)在大陸唯一的一本生物信息學(xué)習(xí)題解答，包括上機(jī)題目中不少也有文字版本的具體解答。 4.M.Michael Gromiha,Protein Bioinformatics:From Sequence to Function,Elsevier,2001. 意見僅供參考。 |
8樓2014-07-09 10:29:53
相關(guān)版塊跳轉(zhuǎn)
我要訂閱樓主 tianti_121 的主題更新
| 8 | 1/1 | 返回列表 |
| 最具人氣熱帖推薦 [查看全部] | 作者 | 回/看 | 最后發(fā)表 | |
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 生物學(xué)學(xué)碩，一志愿湖南大學(xué)，初試成績(jī)338 +7 | YYYYYNNNNN 2026-03-26 | 8/400 |
|
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 0703化學(xué)求調(diào)劑 +6 | 丹青奶蓋 2026-03-26 | 8/400 |
|
|
|
[考研] 317分 一志愿南理工材料工程 本科湖工大 求調(diào)劑 +12 | 芋泥小鈴鐺 2026-03-28 | 12/600 |
|
|
|
[考研] 346求調(diào)劑 一志愿070303有機(jī)化學(xué) +6 | 蘿卜燉青菜 2026-03-28 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 277跪求調(diào)劑 +7 | 1915668 2026-03-27 | 11/550 |
|
|
|
[考研] 318一志愿吉林大學(xué)生物與醫(yī)藥 求調(diào)劑 +5 | 篤行致遠(yuǎn). 2026-03-28 | 5/250 |
|
|
|
[考研]
 一志愿武漢理工，總分321，英一數(shù)二，求老師收留。
+11
|
nnnnnnn5 2026-03-25 | 11/550 |
|
|
|
[考研] 一志愿南昌大學(xué)324求調(diào)劑 +5 | hanamiko 2026-03-29 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 22408 359分調(diào)劑 +4 | Qshers 2026-03-27 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 320分，材料與化工專業(yè)，求調(diào)劑 +9 | 一定上岸aaa 2026-03-27 | 13/650 |
|
|
|
[考研] 394求調(diào)劑 +3 | 好事多磨靜候佳?/a> 2026-03-26 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 317求調(diào)劑 +6 | 十閑wx 2026-03-24 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 286求調(diào)劑 +12 | PolarBear11 2026-03-26 | 12/600 |
|
|
|
[考研] 材料求調(diào)劑一志愿哈工大324 +7 | 閆旭東 2026-03-28 | 9/450 |
|
|
|
[考研] 285求調(diào)劑 +4 | AZMK 2026-03-27 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 化學(xué)調(diào)劑 +4 | 愛吃番茄的旭 2026-03-24 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 一志愿南師大0703化學(xué) 275求調(diào)劑 +4 | Ripcord上岸 2026-03-27 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 085600，材料與化工321分調(diào)劑 +4 | 大饞小子 2026-03-27 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 296求調(diào)劑 +4 | 汪！？！ 2026-03-25 | 7/350 |
|
|
|
[考研]
 085404電子信息284分求調(diào)劑
+4
|
13659058978 2026-03-24 | 4/200 |
|