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lzbull木蟲(chóng) (小有名氣)
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[求助]
求問(wèn)PopGene軟件數(shù)據(jù)文件內(nèi)數(shù)據(jù)排列問(wèn)題
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小弟最近在用PopGene處理數(shù)據(jù)，但是有一事一直不太明白，看了些文獻(xiàn)依舊不是很懂，忘高手不吝賜教啊。 背景：SRAP種群遺傳多樣性分析。一共是12個(gè)種群，每個(gè)種群8到12個(gè)樣品。一共用了11對(duì)引物。 ————————————我是多態(tài)性分割線(xiàn)———————————————— 我看了一下PopGene的幫助文件，它里面的數(shù)據(jù)格式是這個(gè)樣子的。 /* Diploid alphabetic data of 3 populations each with varying records (genotypes) & 5 loci */ Number of populations = 2 Number of loci =28 Locus name : OPA01-1 OPA01-2 OPA01-3 OPA01-4 OPA01-5 OPA03-1 OPA03-2 OPA03-3 OPA03-4 OPA03-5 OPA03-6 OPA04-1 OPA04-2 OPA04-3 OPA04-4 OPA04-5 OPA04-6 OPA04-7 OPA07-1 OPA07-2 OPA07-3 OPA07-4 OPA07-5 OPA07-6 OPA11-1 OPA11-2 OPA11-3 OPA11-4 name = Slave Lake fis = -0.238 11101 100100 0111010 001000 1001 10110 100100 0011010 001000 0001 11100 100100 0011010 001000 0001 11111 100100 0011010 001010 0001 10110 101100 0011010 001010 1101 我這個(gè)地方就不懂了。  我這12對(duì)引物，12個(gè)居群，每個(gè)居群10個(gè)左右樣品時(shí)如何組織到這個(gè)文件里面的。就是我現(xiàn)在懂了文件的數(shù)據(jù)格式，但是不知道這個(gè)數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)。 小弟嘴拙，不知道表達(dá)清楚沒(méi)有。  望前輩指教。 PS：還想問(wèn)一下這個(gè) fis 是什么東西，不考慮它行么？ [ Last edited by lzbull on 2013-10-29 at 16:11 ] |
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還有個(gè)問(wèn)題就是，我的每個(gè)地方的樣品數(shù)的個(gè)數(shù)不太一樣，我想問(wèn)一下：這樣處理問(wèn)題的話(huà)是要注意哪些？是這樣我處理數(shù)據(jù)的時(shí)候老是出問(wèn)題嗎？ |
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該學(xué)習(xí)了你9樓2015-02-02 15:07:52
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10樓2015-02-02 22:52:14
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