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求問PopGene軟件數(shù)據(jù)文件內(nèi)數(shù)據(jù)排列問題
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小弟最近在用PopGene處理數(shù)據(jù)，但是有一事一直不太明白，看了些文獻(xiàn)依舊不是很懂，忘高手不吝賜教啊。 背景：SRAP種群遺傳多樣性分析。一共是12個(gè)種群，每個(gè)種群8到12個(gè)樣品。一共用了11對引物。 ————————————我是多態(tài)性分割線———————————————— 我看了一下PopGene的幫助文件，它里面的數(shù)據(jù)格式是這個(gè)樣子的。 /* Diploid alphabetic data of 3 populations each with varying records (genotypes) & 5 loci */ Number of populations = 2 Number of loci =28 Locus name : OPA01-1 OPA01-2 OPA01-3 OPA01-4 OPA01-5 OPA03-1 OPA03-2 OPA03-3 OPA03-4 OPA03-5 OPA03-6 OPA04-1 OPA04-2 OPA04-3 OPA04-4 OPA04-5 OPA04-6 OPA04-7 OPA07-1 OPA07-2 OPA07-3 OPA07-4 OPA07-5 OPA07-6 OPA11-1 OPA11-2 OPA11-3 OPA11-4 name = Slave Lake fis = -0.238 11101 100100 0111010 001000 1001 10110 100100 0011010 001000 0001 11100 100100 0011010 001000 0001 11111 100100 0011010 001010 0001 10110 101100 0011010 001010 1101 我這個(gè)地方就不懂了。  我這12對引物，12個(gè)居群，每個(gè)居群10個(gè)左右樣品時(shí)如何組織到這個(gè)文件里面的。就是我現(xiàn)在懂了文件的數(shù)據(jù)格式，但是不知道這個(gè)數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)。 小弟嘴拙，不知道表達(dá)清楚沒有。  望前輩指教。 PS：還想問一下這個(gè) fis 是什么東西，不考慮它行么？ [ Last edited by lzbull on 2013-10-29 at 16:11 ] |
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4樓2013-12-01 19:13:33
2樓2013-10-29 20:45:29
dplfly
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3樓2013-11-30 22:00:43
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5樓2014-05-29 09:50:22
6樓2014-05-29 17:57:20
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7樓2014-05-31 16:28:23
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8樓2015-02-02 15:04:42
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還有個(gè)問題就是，我的每個(gè)地方的樣品數(shù)的個(gè)數(shù)不太一樣，我想問一下：這樣處理問題的話是要注意哪些？是這樣我處理數(shù)據(jù)的時(shí)候老是出問題嗎？ |
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該學(xué)習(xí)了你9樓2015-02-02 15:07:52
10樓2015-02-02 22:52:14
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