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abc40821149金蟲 (小有名氣)
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Fullprof 擬合的峰強(qiáng)度一直上不去 已有2人參與
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用Fullprof 擬合一個(gè) P n m a空間群的晶體，發(fā)現(xiàn)擬合的強(qiáng)度一直上不去，仔細(xì)檢查了一下發(fā)現(xiàn)，在18°附近的擬合峰的強(qiáng)度超過(guò)了實(shí)驗(yàn)值，而其他的峰都比實(shí)驗(yàn)值要低很多，圖一是整體的擬合結(jié)果，圖二是局部細(xì)節(jié)圖，是不是PCR中什么參數(shù)沒(méi)有設(shè)對(duì)��？希望大家?guī)臀铱纯�，提提意�?jiàn)？ 圖1.jpg 圖2.jpg |
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sdut123
新蟲 (初入文壇)
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【答案】應(yīng)助回帖
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剛開始用這個(gè)軟件的時(shí)候我也遇到過(guò)這樣的問(wèn)題：解決步驟如下 1.首選確定你所選定的空間對(duì)稱群對(duì)不對(duì),用jade對(duì)粗略看一下，確定以下對(duì)稱群，從http://www.crystallography.net/下載相應(yīng)的晶體晶體結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)，用maud進(jìn)行初步優(yōu)化得到靠譜的晶體結(jié)構(gòu)參數(shù) 2. 以下的參數(shù)需要反復(fù)的refine 首先是scale coefficient 其次 你所選定的background，再次晶格常數(shù)a,b,c以及 alpha, beta, gamma (3)instrument+ scale coefficients(4)FWHM parameters U+V(一起選中修正)，U+W，W+U (5) Eta_0 (6) 所有原子的坐標(biāo)加scale一起修正 （8）每一個(gè)原子的Occ 修正一遍 （9）scale+ preferred orientation 即G1 （10）Occ， B 以及原子位置坐標(biāo)和 晶格常數(shù) 成鍵角度 反復(fù)修正 最好的所得到的chi2數(shù)值越小越好 最好在3以下。我的情況最終是在Occ， B 以及原子位置坐標(biāo)和 晶格常數(shù) 成鍵角度 反復(fù)修正的條件下解決的。 |
2樓2019-07-01 20:55:49
王小汪zz
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3樓2019-07-01 20:58:34
loaferfdu
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4樓2019-07-01 23:25:46
loaferfdu
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5樓2019-07-01 23:27:14
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