 |
 |
 |
 |
 |
 |
||
 |
 |
 |
 |
 |
| 1 | 1/1 | 返回列表 |
| 查看: 800 | 回復: 0 | |||
鄧芳木蟲 (小有名氣)
木蟲
|
[求助]
高斯優(yōu)化問題和gromacs小分子的tip文件中的電荷修改問題
|
|
請教你一個問題：我的小分子mol2格式，如圖一所示：但用高斯優(yōu)化后就變成如圖二所示，c-n鍵發(fā)生了變化，請問大神這種問題怎么解決？我想用高斯優(yōu)化后的電荷來代替在線生成的tip文件中的電荷，但化學鍵發(fā)生了變化，電荷應該有點問題，所以沒辦法往下進行了。還有一個問題是：高斯優(yōu)化后的log文件中的電荷，要么是全氫，要么是沒有氫，而在線生成的tip文件中的氫原子是部分氫，怎樣才能實現(xiàn)對應的替換？關于電荷修改問題一篇文獻中介紹過了，但沒看太明白，想通過高斯進行解決，希望盡快得到大家的幫助，讓實驗盡快進行下去，非常感謝！ 1.jpg 2.jpg |
回復此樓» 猜你喜歡
復試調(diào)劑，一志愿南農(nóng)083200食品科學與工程
已經(jīng)有4人回復
-
一志愿太原理工安全工程300分，求調(diào)劑
已經(jīng)有3人回復
-
284求調(diào)劑
已經(jīng)有11人回復
-
食品工程專碩求調(diào)劑
已經(jīng)有3人回復
-
324求調(diào)劑
已經(jīng)有7人回復
-
一志愿武漢理工，總分321，英一數(shù)二，求老師收留。
已經(jīng)有4人回復
-
287求調(diào)劑
已經(jīng)有7人回復
-
325求調(diào)劑
已經(jīng)有5人回復
-
343求調(diào)劑
已經(jīng)有4人回復
-
求調(diào)劑推薦 材料 304
已經(jīng)有4人回復
» 本主題相關商家推薦: (我也要在這里推廣)
找到一些相關的精華帖子，希望有用哦~
Namd， Gromacs 可以計算分子中電荷分布隨時間的變化嗎？
已經(jīng)有4人回復
- MS文件的讀取問題
已經(jīng)有4人回復
- gromacs計算時原系統(tǒng)帶電荷，如何添加離子中和電性？
已經(jīng)有8人回復
- 【轉帖】用Amber+Gaussian做小分子力場
已經(jīng)有16人回復
- 【討論】gromacs電荷不為整數(shù)
已經(jīng)有6人回復
點擊這里搜索更多相關資源科研從小木蟲開始，人人為我，我為人人
相關版塊跳轉
我要訂閱樓主 鄧芳 的主題更新
| 1 | 1/1 | 返回列表 |
| 最具人氣熱帖推薦 [查看全部] | 作者 | 回/看 | 最后發(fā)表 | |
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 286求調(diào)劑 +3 | lim0922 2026-03-26 | 3/150 |
|
|---|---|---|---|---|
|
|
[考研] 305求調(diào)劑 +4 | 哇盧卡庫 2026-03-26 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 081200-11408-276學碩求調(diào)劑 +3 | 崔wj 2026-03-26 | 3/150 |
|
|
[考研]
 085602 289分求調(diào)劑
+8
|
WWW西西弗斯 2026-03-24 | 8/400 |
|
|
|
[考研] 085601求調(diào)劑總分293英一數(shù)二 +4 | 鋼鐵大炮 2026-03-24 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 292求調(diào)劑 +9 | 鵝鵝鵝額額額額?/a> 2026-03-25 | 10/500 |
|
|
|
[考研] 22 350 本科985求調(diào)劑，求老登收留 +4 | 李軼男003 2026-03-20 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 279 分 求調(diào)劑 +3 | 睡個好覺_16 2026-03-24 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 一志愿 南京郵電大學 288分 材料考研 求調(diào)劑 +3 | jl0720 2026-03-26 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 材料專碩 335 分求調(diào)劑 +4 | 拒絕冷暴力 2026-03-25 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 各位老師您好：本人初試372分 +5 | jj涌77 2026-03-25 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 282求調(diào)劑 +3 | wcq131415 2026-03-24 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 一志愿吉林大學材料與化工303分求調(diào)劑 +4 | 為學666 2026-03-24 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 289材料與化工（085600）B區(qū)求調(diào)劑 +4 | 這么名字咋樣 2026-03-22 | 5/250 |
|
|
|
[有機交流]
有機合成求助
 20+3
|
FENGSHUJEI 2026-03-23 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 306求0703調(diào)劑一志愿華中師范 +10 | 紙魚ly 2026-03-21 | 11/550 |
|
|
|
[考研] 269求調(diào)劑 +4 | 我想讀研11 2026-03-23 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 336求調(diào)劑 +4 | 收到VS 2026-03-20 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 306求調(diào)劑 +5 | 來好運來來來 2026-03-22 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 336求調(diào)劑 +5 | rmc8866 2026-03-21 | 5/250 |
|