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[求助]
CF3COOH(介電常數為:8.55)作溶劑,計算分子溶劑化能的詳細輸入文件。!
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請教各位大神,高斯中沒有的溶劑化模型如何建立?以CF3COOH(介電常數 8.55)為溶劑,計算一個分子的溶劑化能,急求該計算的詳細輸入文件! 情況緊急,還望各位不吝賜教!不勝感激。。 |
計算 | gaussian |
木蟲 (著名寫手)
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http://www.gaoyang168.com/html/201302/5536617.html 這里有講。 以下節(jié)選自高斯09說明書: PCM計算的附加關鍵詞 PCM SCRF計算可以指定附加的輸入關鍵詞。它們位于獨立的輸入部分,像往常一樣用空行結束,如這個例子: # B3LYP/6-31G(d) 5D SCRF(SMD,Solvent=Generic,PCM=Read) Water, solvation by methanol, re-defined as generic solvent. 0 1 O H,1,0.94 H,1,0.94,2,104.5 stoichiometry=C1H4O1 PCM關鍵詞的輸入部分 solventname=methanol eps=32.63 epsinf=1.758 … PCM輸入的結束空行 可以用以下關鍵詞控制 PCM 計算(有關的項目分組排列): 定義溶劑參數 PCM 計算所用的溶劑通?梢杂肧CRF 關鍵詞的常規(guī)選項Solvent 指定?梢杂孟旅 的關鍵詞覆蓋一些已知溶劑的默認值: EPS=x 指定溶劑的靜態(tài)(或零頻)介電常數。 EPSINF=x 指定溶劑的動態(tài)(或光學)介電常數。 RSOLV=x 指定溶劑半徑(單位:埃)。只用于AddSph 或Surface=SAS。 未指定的參數默認為Solvent選項所指定溶劑(默認是水)的值。 這兩種說法矛盾的地方就是一個是直接用read,一個是用pcm=read,孰對孰錯自己嘗試吧。 |
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再請教幾個問題: 1. 關鍵詞命令行:# B3LYP/6-31G(d) 5D SCRF(SMD,Solvent=Generic,PCM=Read) 中的"5D" 是什么意思啊? 2.如果含有: stoichiometry=C1H4O1 solventname=methanol 計算報錯,去掉則可以正常運算,不知是何原因? 3.即使按照該輸入文件計算,能夠在out 文件中看到我建立的新的溶劑模型,但沒有計算結果,也就是沒有我要的溶劑的相關一些列能量值(氣相,極性溶劑極性溶質能量,總溶液能量,溶劑自由能,溶劑化能..) 見附件:H2O-ch3oh.gjf 和 H2O-ch3oh.out 4.針對上一個問題,我在命令行加入了關鍵詞:ExternalIteration,DoVacuum" 貌似可以得到全部的結果,不知是否可靠? 見附件:H2O-ch3oh-3.gjf 和 H2O-ch3oh-3.out |
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木蟲 (著名寫手)
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