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aoda123木蟲(chóng) (正式寫(xiě)手)
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BsaI的酶切位點(diǎn)怎么看？
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求助，BsaI的酶切位點(diǎn)怎么看？ 5’.....GGTCTC（N）1.....3‘ 3’.....CCAGAG（N）5......5‘ 上面的N代表什么��？ |
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anyaxiong
鐵桿木蟲(chóng) (知名作家)
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【答案】應(yīng)助回帖
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感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
gyesang: 金幣+3, 鼓勵(lì)交流！ 2013-11-11 21:29:19
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| N 代表沒(méi)有測(cè)定的堿基。比如在測(cè)序過(guò)程中出現(xiàn)gap，那么這一段都用N來(lái)代替這些還沒(méi)有測(cè)序、尚不明確的堿基。U不會(huì)出現(xiàn)在DNA序列中。U在分子生物學(xué)中表示堿基時(shí)只代表尿嘧啶。還有，提供給樓主一些常用的簡(jiǎn)并堿基代碼。也就是說(shuō)，可以用一個(gè)字母表示幾種堿基。簡(jiǎn)并/混合堿基 A+C+G → V簡(jiǎn)并/混合堿基 A+T+G → D簡(jiǎn)并/混合堿基 T+C+G → B簡(jiǎn)并/混合堿基 A+T+C → H簡(jiǎn)并/混合堿基 A+T → W簡(jiǎn)并/混合堿基 C+G → S簡(jiǎn)并/混合堿基 T+G → K簡(jiǎn)并/混合堿基 A+C → M簡(jiǎn)并/混合堿基 C+T → Y簡(jiǎn)并/混合堿基 A+G → R簡(jiǎn)并/混合堿基 A+G+C+T → N樓主所說(shuō)的N，其實(shí)就是最后一種情況，N可以代表A G C T 中的任何一個(gè)，常用在測(cè)序結(jié)果的gap中，以及設(shè)計(jì)簡(jiǎn)并引物的過(guò)程中。 |
2樓2013-11-11 20:07:56
gyesang
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3樓2013-11-11 21:30:31
aoda123
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4樓2013-11-11 21:33:57
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5樓2013-11-12 01:34:12
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