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shenzhendsh鐵蟲(chóng) (小有名氣)
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[求助]
Gaussian TDDFT 激發(fā)態(tài) 頻率計(jì)算 輸入文件
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我要計(jì)算單重激發(fā)態(tài)的頻率，輸入文件如下： %chk=chk.chk %nprocshared=8 %mem=3200MB # freq td=(nstates=30,root=1,singlet) b3lyp tzvp title Cartesians coordination 請(qǐng)問(wèn)為何一直算不完，而且有很多SCF Done能量？正確的輸入命令是什么呢？ 對(duì)于激發(fā)態(tài)過(guò)渡態(tài)的優(yōu)化，輸入命令又是什么呢？ 剛接觸激發(fā)態(tài)計(jì)算，還望大家不吝賜教！非常感謝！ |
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槍下游魂
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【答案】應(yīng)助回帖
★ ★ ★ ★
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
shenzhendsh: 金幣+1 2013-11-12 17:25:10
gmy1990: 金幣+3 2013-11-12 17:25:36
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gmy1990: 金幣+3 2013-11-12 17:25:36
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一直算不完是什么意思？算了一天？?jī)商�？而且你算�?0個(gè)激發(fā)態(tài)，如果體系大的話算個(gè)十幾天都很正常。 SCF的能量不用管它，都會(huì)算的，只需關(guān)注最后一次循環(huán)的輸出結(jié)果即可。 如果要做激發(fā)態(tài)過(guò)渡態(tài)優(yōu)化，加opt關(guān)鍵詞就可以了，但注意如此做的話最好用--Link1--把opt與freq分成兩個(gè)任務(wù)來(lái)算，不然很有可能會(huì)報(bào)錯(cuò)。 |
2樓2013-11-12 16:21:39
shenzhendsh
鐵蟲(chóng) (小有名氣)
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多謝回復(fù)！體系含三個(gè)V，8個(gè)O，一個(gè)C，四個(gè)H，8個(gè)CPU跑了兩天了，而且SCF Done的能量幾乎不變。 做激發(fā)態(tài)過(guò)渡態(tài)優(yōu)化時(shí)，只加opt不行吧，我加了opt（ts,calcfc）,結(jié)果報(bào)錯(cuò)如下：No analytic 2nd derivatives for this method. >Error termination via Lnk1e in /home/soft/g09/l1.exe at Tue Nov 12 11:30:43 2013. 優(yōu)化時(shí)應(yīng)加什么關(guān)鍵詞呢？多謝回復(fù)！ |
3樓2013-11-12 16:27:56
槍下游魂
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4樓2013-11-12 16:48:48
pwzhou
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【答案】應(yīng)助回帖
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zhou2009: 金幣+5 2013-11-14 14:27:24
shenzhendsh: 金幣+5 2013-11-17 16:27:42
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
zhou2009: 金幣+5 2013-11-14 14:27:24
shenzhendsh: 金幣+5 2013-11-17 16:27:42
| Gaussian的TDDFT算激發(fā)態(tài)頻率是數(shù)值的，所以需要算6N+1次（N是體系的原子數(shù)目）TD，所以你會(huì)找到6N+1個(gè)"SCF Done"，什么時(shí)候"SCF Done"的數(shù)目到達(dá)這個(gè)了，什么時(shí)候你的激發(fā)態(tài)頻率計(jì)算就結(jié)束了。2天時(shí)間太少，TDDFT算個(gè)激發(fā)態(tài)頻率20天到一個(gè)月都是正常的，慢慢等吧。沒(méi)事數(shù)數(shù)"SCF Done"的數(shù)目，大概估算一下需要算多久吧。 |
5樓2013-11-14 13:53:10
shenzhendsh
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6樓2013-11-17 16:27:31
blueybz
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小范范1989
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大神你好，我在這問(wèn)您個(gè)問(wèn)題，就是我有個(gè)分子，大約含有110額原子，之前優(yōu)化激發(fā)態(tài)一直出錯(cuò)，使用的方法是b3lyp/6-31g*。假如說(shuō)，我計(jì)算激發(fā)態(tài)的頻率，能使用b3lyp/6-31g*嗎？sob給的解說(shuō)是這樣的：Gaussian沒(méi)有TDDFT解析二階導(dǎo)數(shù)，這是幾乎做不動(dòng)的，耗時(shí)我估計(jì)是600~1200次激發(fā)能計(jì)算的耗時(shí)。必須要計(jì)算頻率的話，只能是在CIS下優(yōu)化并計(jì)算頻率，因?yàn)镃IS下有解析二階導(dǎo)數(shù)，速度和TDDFT計(jì)算頻率耗時(shí)完全不在一個(gè)數(shù)量級(jí)。 我想，基態(tài)是b3lyp/6-31g*,激發(fā)態(tài)用CIS能行嗎？b3lyp真的做不了我的這個(gè)計(jì)算？我曾經(jīng)計(jì)算過(guò)一個(gè)70個(gè)分子，很長(zhǎng)很長(zhǎng)時(shí)間，我該怎么辦？謝謝pwzhou的指點(diǎn)。謝謝您 |
8樓2015-01-14 23:41:04
憂凝聽(tīng)雨軒
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你好，請(qǐng)問(wèn)激發(fā)態(tài)的頻率計(jì)算怎么做？為什么我計(jì)算老出錯(cuò) 分子的激發(fā)態(tài)優(yōu)化后做頻率計(jì)算 輸入文件是 %chk=b.chk %rwf=b.rwf %mem=200MW %nprocshare=12 # freq td=(singlets,nstates=6,root=1) b3lyp/6-31g(d) 計(jì)算到下邊就停止了 SavETr: write IOETrn= 770 NScale= 10 NData= 16 NLR=1 LETran= 118. IDoAtm=1111111111111111111111111111111111111111 Differentiating once with respect to electric field. with respect to dipole field. Differentiating once with respect to nuclear coordinates. There are 1 degrees of freedom in the 1st order CPHF. IDoFFX=0. LinEq1: Iter= 0 NonCon= 1 RMS=2.02D-03 Max=2.21D-01 AX will form 1 AO Fock derivatives at one time. LinEq1: Iter= 1 NonCon= 1 RMS=4.31D-04 Max=2.25D-02 LinEq1: Iter= 2 NonCon= 1 RMS=2.91D-04 Max=1.36D-02 LinEq1: Iter= 3 NonCon= 1 RMS=2.27D-04 Max=1.60D-02 LinEq1: Iter= 4 NonCon= 1 RMS=1.99D-04 Max=1.26D-02 LinEq1: Iter= 5 NonCon= 1 RMS=1.04D-04 Max=6.16D-03 LinEq1: Iter= 6 NonCon= 1 RMS=5.06D-05 Max=1.92D-03 LinEq1: Iter= 7 NonCon= 1 RMS=2.28D-05 Max=1.17D-03 LinEq1: Iter= 8 NonCon= 1 RMS=1.49D-05 Max=1.22D-03 LinEq1: Iter= 9 NonCon= 1 RMS=1.48D-05 Max=1.31D-03 LinEq1: Iter= 10 NonCon= 1 RMS=7.12D-06 Max=2.68D-04 LinEq1: Iter= 11 NonCon= 1 RMS=3.05D-06 Max=1.36D-04 LinEq1: Iter= 12 NonCon= 1 RMS=2.41D-06 Max=1.46D-04 LinEq1: Iter= 13 NonCon= 1 RMS=1.28D-06 Max=5.58D-05 |
9樓2016-01-19 22:48:51
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