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陳鬧鐘金蟲 (初入文壇)
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[求助]
關(guān)于amber中g(shù)aff力場和amber力場的原子類型的對應(yīng)關(guān)系的問題
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| 由于AMBER中GAFF力場是用小寫字母表示的，AMBER力場是用大寫字母表示的，現(xiàn)在我有個小分子得用到GAFF力場，同時這個小分子與蛋白質(zhì)本身還有鍵的作用，這就會出現(xiàn)諸如：C - ne - cf 這種力場參數(shù)沒有的提示，所以我想問下說：GAFF力場的每個原子類型與AMBER的原子類型是不是有對應(yīng)關(guān)系？（比如說能再力場文件里面找到GAFF的"o" 對應(yīng)AMBER中的“O2”這樣的信息？？） 謝謝！ |
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fhh2626
木蟲 (正式寫手)
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2樓2013-11-13 21:00:14
陳鬧鐘
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3樓2013-11-13 23:12:38
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