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dongch04

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[求助] dispersion在弱相互作用中所占的比重

本人剛開始接觸量化計(jì)算，想請(qǐng)教資深蟲蟲一個(gè)問題：dispersion在計(jì)算弱相互作用中所占比重的百分比。最好能有文獻(xiàn)支持

目前計(jì)算體系中的弱相互作用主要是OH-O氫鍵，涉及部分CH-Pi相互作用。但計(jì)算版本中不含dispersion，如果dispersion所占比重不大就不考慮它的作用了。

如能推薦這方面的資料，也萬(wàn)分感謝！

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1樓 2013-11-18 21:36:22

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lishijunzong

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看看作者grimme的文章吧,具體占多少，真的不是很清楚

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2樓2013-11-18 22:53:55

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謝謝推薦，認(rèn)真看了本站諸多大牛的帖子，討論了一些弱相互作用的計(jì)算。由于目前結(jié)果已經(jīng)把b3lyp算完，不想再考慮色散作用重新計(jì)算，當(dāng)初選泛函的時(shí)候認(rèn)為體系主要是羥基間的氫鍵作用，CH-Pi作用很少，因此想給出一個(gè)百分比例說(shuō)明現(xiàn)有的方法也是可行的。

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3樓2013-11-18 23:44:38

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bittersmile

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gkf高: 金幣+2 2013-11-20 09:19:03

你最好挑一個(gè)目前結(jié)果中的結(jié)構(gòu)用dft-d重新算一個(gè)，不用優(yōu)化，直接算相互作用，然后和dft比較，不就有一個(gè)百分比了么？這樣做更能驗(yàn)證你的實(shí)例到底dispersion重要不重要。

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4樓2013-11-19 00:17:07

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virtualzx

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gmy1990: 金幣+2 2013-11-19 05:19:25

引用回帖:

3樓: Originally posted by dongch04 at 2013-11-18 10:44:38
謝謝推薦，認(rèn)真看了本站諸多大牛的帖子，討論了一些弱相互作用的計(jì)算。由于目前結(jié)果已經(jīng)把b3lyp算完，不想再考慮色散作用重新計(jì)算，當(dāng)初選泛函的時(shí)候認(rèn)為體系主要是羥基間的氫鍵作用，CH-Pi作用很少，因此想給出一個(gè) ...

我也沒有數(shù)字，如果你不帶電荷，色散力在OH...O大概是20-30%的樣子，CH-pi的比例要高一些，但是也不好估計(jì)，各人算得差別很大。

不過(guò)有20%色散力不代表B3LYP就一定會(huì)誤差20%。色散力的誤差和基組造成的誤差一般符號(hào)相反相互抵消，密度泛函本身也有些不確定性，所以如果運(yùn)氣好可能差的不太多。最好算下單點(diǎn)驗(yàn)證下。

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5樓2013-11-19 00:25:53

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4樓: Originally posted by bittersmile at 2013-11-19 00:17:07
你最好挑一個(gè)目前結(jié)果中的結(jié)構(gòu)用dft-d重新算一個(gè)，不用優(yōu)化，直接算相互作用，然后和dft比較，不就有一個(gè)百分比了么？這樣做更能驗(yàn)證你的實(shí)例到底dispersion重要不重要。

我用的gaussian03還不包含dft-d的模塊，所以才有這個(gè)問題的。

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6樓2013-11-19 23:29:25

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5樓: Originally posted by virtualzx at 2013-11-19 00:25:53
我也沒有數(shù)字，如果你不帶電荷，色散力在OH...O大概是20-30%的樣子，CH-pi的比例要高一些，但是也不好估計(jì)，各人算得差別很大。

不過(guò)有20%色散力不代表B3LYP就一定會(huì)誤差20%。色散力的誤差和基組造成的誤差一般 ...

我也考慮這個(gè)具體比例很難給出，因?yàn)橄噍^體系不同肯定反映出來(lái)的權(quán)重也不同，不過(guò)如果能有一個(gè)統(tǒng)一的范圍比例就最好了。

還有我的計(jì)算體系中同時(shí)含有oh-o和ch-pi，只是oh-o和oh-oh氫鍵更多些，還有我用的基組算是挺高了，B3LYP/6-311+G(d)加上MP2/6-311++G(d, p)。不知是否會(huì)影響到色散作用的比例？

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7樓2013-11-19 23:36:55

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引用回帖:

7樓: Originally posted by dongch04 at 2013-11-19 10:36:55
我也考慮這個(gè)具體比例很難給出，因?yàn)橄噍^體系不同肯定反映出來(lái)的權(quán)重也不同，不過(guò)如果能有一個(gè)統(tǒng)一的范圍比例就最好了。

還有我的計(jì)算體系中同時(shí)含有oh-o和ch-pi，只是oh-o和oh-oh氫鍵更多些，還有我用的基組算 ...

6-311+G(d)其實(shí)是蠻小的基組，但是你體系太大的話也沒什么辦法。但我的意思是，基組太大了結(jié)果反而差得遠(yuǎn)，這個(gè)大小的基組很可能給你比大基組更好的結(jié)果，但是paper上當(dāng)然不能這么說(shuō)。你是多大的體系呢？GAMESS也可以做DFT-D3的

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8樓2013-11-20 07:47:20

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8樓: Originally posted by virtualzx at 2013-11-20 07:47:20
6-311+G(d)其實(shí)是蠻小的基組，但是你體系太大的話也沒什么辦法。但我的意思是，基組太大了結(jié)果反而差得遠(yuǎn)，這個(gè)大小的基組很可能給你比大基組更好的結(jié)果，但是paper上當(dāng)然不能這么說(shuō)。你是多大的體系呢？GAMESS也可 ...

我的體系有52個(gè)原子，cho。由于計(jì)算資源的限制再高的基組算的太慢，并且因?yàn)榧尤肓藌pe矯正，還有頻率計(jì)算很耗時(shí)間（我算的構(gòu)型很多）。就是不知道paper上怎么回避這個(gè)問題，才考慮能不能加上百分比來(lái)說(shuō)明，看來(lái)想找到有根有據(jù)的支持是不太可能了

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9樓2013-11-20 11:16:25

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9樓: Originally posted by dongch04 at 2013-11-19 22:16:25
我的體系有52個(gè)原子，cho。由于計(jì)算資源的限制再高的基組算的太慢，并且因?yàn)榧尤肓藌pe矯正，還有頻率計(jì)算很耗時(shí)間（我算的構(gòu)型很多）。就是不知道paper上怎么回避這個(gè)問題，才考慮能不能加上百分比來(lái)說(shuō)明，看來(lái)想找 ...

其實(shí)你可以在gamess下做單點(diǎn)DFT-D，和你本來(lái)的單點(diǎn)計(jì)算的相互作用能對(duì)比一下，不一定要重新做zpe，這樣應(yīng)該不會(huì)太費(fèi)時(shí)間

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10樓2013-11-20 11:29:45

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