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yx007yx007新蟲 (小有名氣)
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[求助]
高斯如何計算在純醋酸溶液中反應(yīng)的自由能變化呢？
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最近做了一個化學(xué)反應(yīng)是在純醋酸（液態(tài)）中用反應(yīng)物A 和B 與醋酸分子共同反應(yīng)產(chǎn)生一系列產(chǎn)物。 醋酸在這里既是溶劑也是反應(yīng)物之一。 產(chǎn)物的成分都已經(jīng)做了分析。 用高斯對各種物質(zhì)的氣相結(jié)構(gòu)都做了優(yōu)化。 問題是怎么計算在純醋酸的體系下溶質(zhì)分子的吉布斯自由能再計算反應(yīng)自由能變化呢？ 簡單的把醋酸當(dāng)作一般溶劑處理可以么？ 比如像這里建議的，輸入如下參數(shù)就可以么還是有特殊的處理方法？ "wolfzhong (站內(nèi)聯(lián)系TA) 可以，IEFPCM就合適離子型溶液，具體見help。 給個直接的例子： SCRF=(IEFPCM,Read,Solvent=DMSO) SCF=tight （這里DMSO和我想模擬的離子溶液接近） SCFVAC （真空中用HF方法） IONIC（Performs a PCM calculation for ionic solution according to the IEF-PCM formalism.） RADII=UAHF （radii optimized for the HF/6-31G(d) level of theory ） TSARE=0.3 （Set the average area of the tesserae generated on each sphere in the cavity surface） TABS=353 （絕對溫度 K） TSNUM=240 （每個分子表面的劃分成多少小塊） EPS=13 （介電常數(shù)） DENSITY=0.003883 （溶液密度） VMOL=154.37 （溶劑的摩爾體積） RSOLV=2.83 （溶劑分子的半徑） DISM=6.45 （離子強(qiáng)度，根據(jù)體系設(shè)定）" 謝謝！ |
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【答案】應(yīng)助回帖
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感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
yx007yx007: 金幣+5, ★★★很有幫助 2013-11-22 04:35:51
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yx007yx007: 金幣+5, ★★★很有幫助 2013-11-22 04:35:51
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以醋酸為溶劑吧，重新定義一個溶劑模型： 可以按照如下方式定義： scrf=(pcm,solvent=generic,read) 在文件結(jié)尾給出 SolventName= acetate 這個你可以隨便起一個名字 EpsInf=X 這個是頻率依賴的介電常數(shù)，數(shù)值是折射率的平方。 Eps=X 這個是介電常數(shù) Gaussian公司官方的Clemente博士說：“重新定義溶劑，如果是基態(tài)計算，只需要Eps，如果是激發(fā)態(tài)計算，兩個都需要”。 |
2樓2013-11-21 09:30:14
yx007yx007
新蟲 (小有名氣)
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3樓2013-11-22 04:34:48
4樓2013-12-06 22:55:08
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