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yx007yx007新蟲 (小有名氣)
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高斯如何計(jì)算在純醋酸溶液中反應(yīng)的自由能變化呢?
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最近做了一個(gè)化學(xué)反應(yīng)是在純醋酸(液態(tài))中用反應(yīng)物A 和B 與醋酸分子共同反應(yīng)產(chǎn)生一系列產(chǎn)物。 醋酸在這里既是溶劑也是反應(yīng)物之一。 產(chǎn)物的成分都已經(jīng)做了分析。 用高斯對(duì)各種物質(zhì)的氣相結(jié)構(gòu)都做了優(yōu)化。 問題是怎么計(jì)算在純醋酸的體系下溶質(zhì)分子的吉布斯自由能再計(jì)算反應(yīng)自由能變化呢? 簡單的把醋酸當(dāng)作一般溶劑處理可以么? 比如像這里建議的,輸入如下參數(shù)就可以么還是有特殊的處理方法? "wolfzhong (站內(nèi)聯(lián)系TA) 可以,IEFPCM就合適離子型溶液,具體見help。 給個(gè)直接的例子: SCRF=(IEFPCM,Read,Solvent=DMSO) SCF=tight (這里DMSO和我想模擬的離子溶液接近) SCFVAC (真空中用HF方法) IONIC(Performs a PCM calculation for ionic solution according to the IEF-PCM formalism.) RADII=UAHF (radii optimized for the HF/6-31G(d) level of theory ) TSARE=0.3 (Set the average area of the tesserae generated on each sphere in the cavity surface) TABS=353 (絕對(duì)溫度 K) TSNUM=240 (每個(gè)分子表面的劃分成多少小塊) EPS=13 (介電常數(shù)) DENSITY=0.003883 (溶液密度) VMOL=154.37 (溶劑的摩爾體積) RSOLV=2.83 (溶劑分子的半徑) DISM=6.45 (離子強(qiáng)度,根據(jù)體系設(shè)定)" 謝謝! |
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以醋酸為溶劑吧,重新定義一個(gè)溶劑模型: 可以按照如下方式定義: scrf=(pcm,solvent=generic,read) 在文件結(jié)尾給出 SolventName= acetate 這個(gè)你可以隨便起一個(gè)名字 EpsInf=X 這個(gè)是頻率依賴的介電常數(shù),數(shù)值是折射率的平方。 Eps=X 這個(gè)是介電常數(shù) Gaussian公司官方的Clemente博士說:“重新定義溶劑,如果是基態(tài)計(jì)算,只需要Eps,如果是激發(fā)態(tài)計(jì)算,兩個(gè)都需要”。 |

新蟲 (小有名氣)

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