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從PDB數(shù)據(jù)庫(kù)中下載的四聚體只有一個(gè)亞基，應(yīng)該如何下載其它三個(gè)亞基的信息
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| 分子對(duì)接還沒(méi)有入門(mén)。想進(jìn)行分子對(duì)接時(shí)，從PDB數(shù)據(jù)庫(kù)中下載的1YHB蛋白應(yīng)該是個(gè)四聚體，可是我下載的數(shù)據(jù)只是一個(gè)亞基。因?yàn)樗幬锝Y(jié)合的活性位點(diǎn)在兩個(gè)亞基之間，因此，想得到兩個(gè)相鄰的亞基的數(shù)據(jù)，不知道怎么下載，或則下載后在DS軟件中如何對(duì)稱操作。非常感謝！ |
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| 的確是一個(gè)亞基，在尋找自己需要的蛋白晶體結(jié)構(gòu)(一個(gè)蛋白通常會(huì)有多個(gè)晶體結(jié)構(gòu)，而且這些結(jié)構(gòu)往往是滿足某一蛋白的特性，比如你現(xiàn)在要找的毗鄰亞基之間的活性位點(diǎn)，蛋白與小分子結(jié)合的晶體復(fù)合物等)，一定注意要多閱讀PDB文件描述，之前走過(guò)很多彎路，越顯而易見(jiàn)的越容易忽略。這個(gè)蛋白是包含了2個(gè)點(diǎn)突變（Y41H and Y41F）Ff噬菌體基因V蛋白。 希望對(duì)你有用 |
2樓2013-11-29 18:31:20
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3樓2013-11-30 13:13:33
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