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從PDB數(shù)據(jù)庫中下載的四聚體只有一個亞基，應該如何下載其它三個亞基的信息
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| 分子對接還沒有入門。想進行分子對接時，從PDB數(shù)據(jù)庫中下載的1YHB蛋白應該是個四聚體，可是我下載的數(shù)據(jù)只是一個亞基。因為藥物結(jié)合的活性位點在兩個亞基之間，因此，想得到兩個相鄰的亞基的數(shù)據(jù)，不知道怎么下載，或則下載后在DS軟件中如何對稱操作。非常感謝！ |
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月只藍: 金幣+3, 感謝指導！ 2013-11-30 10:15:04
| 的確是一個亞基，在尋找自己需要的蛋白晶體結(jié)構(gòu)(一個蛋白通常會有多個晶體結(jié)構(gòu)，而且這些結(jié)構(gòu)往往是滿足某一蛋白的特性，比如你現(xiàn)在要找的毗鄰亞基之間的活性位點，蛋白與小分子結(jié)合的晶體復合物等)，一定注意要多閱讀PDB文件描述，之前走過很多彎路，越顯而易見的越容易忽略。這個蛋白是包含了2個點突變（Y41H and Y41F）Ff噬菌體基因V蛋白。 希望對你有用 |
2樓2013-11-29 18:31:20
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3樓2013-11-30 13:13:33
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