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liuevans木蟲 (正式寫手)
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[求助]
線粒體基因組D-loop區(qū)遇到高度重復(fù)序列，求指點(diǎn) 已有1人參與
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線粒體基因組D-loop區(qū)遇到高度重復(fù)序列，無法測通，請高人指點(diǎn)，具體情況如下。 我最初的打算是測一個蛛形綱動物的線粒體基因組，現(xiàn)在基本測完，只剩下D-loop區(qū)了，這個片段我設(shè)計(jì)的引物是在D-loop區(qū)側(cè)翼，總長3k，擴(kuò)增成功，正常雙向測序，分別測了一個反應(yīng)就測不下去了，因?yàn)閮啥酥貜?fù)序列太多，無法設(shè)計(jì)walking引物，分析已經(jīng)測通的序列結(jié)果，兩端都有tandem repeats，估計(jì)這就是測不通的原因。據(jù)我了解，測序?qū)@種高度串聯(lián)重復(fù)序列很難解決，就算測通也是運(yùn)氣好。所以，求高人指導(dǎo)，希望早日測通，在此謝謝了！ |
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2樓2013-11-29 11:03:55
stoni
銅蟲 (小有名氣)
- 應(yīng)助: 1 (幼兒園)
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- 蟲號: 102022
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- 專業(yè): 動物遺傳學(xué)
3樓2014-12-20 15:54:10
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