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liuevans木蟲 (正式寫手)
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[求助]
線粒體基因組D-loop區(qū)遇到高度重復序列,求指點 已有1人參與
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線粒體基因組D-loop區(qū)遇到高度重復序列,無法測通,請高人指點,具體情況如下。 我最初的打算是測一個蛛形綱動物的線粒體基因組,現在基本測完,只剩下D-loop區(qū)了,這個片段我設計的引物是在D-loop區(qū)側翼,總長3k,擴增成功,正常雙向測序,分別測了一個反應就測不下去了,因為兩端重復序列太多,無法設計walking引物,分析已經測通的序列結果,兩端都有tandem repeats,估計這就是測不通的原因。據我了解,測序對這種高度串聯重復序列很難解決,就算測通也是運氣好。所以,求高人指導,希望早日測通,在此謝謝了! |
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