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雪狼乖乖
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z-matrix 計(jì)算HCN居然出錯(cuò)~~
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# opt=z-matrix am1 Title Card Required 0 1 C H 1 B1 N 1 B2 2 A1 B1 1.06898300 B2 1.16018400 A1 180.00000000 以下是出錯(cuò)信息： Error on Z-matrix card number 3 angle Alpha is outside the valid range of 0 to 180. Conversion from Z-matrix to cartesian coordinates failed: --------------------------------------------------------------------------------------------------- Z-MATRIX (ANGSTROMS AND DEGREES) CD Cent Atom N1 Length/X N2 Alpha/Y N3 Beta/Z J --------------------------------------------------------------------------------------------------- 1 1 C 2 2 H 1 1.068983( 1) 3 3 N 1 1.160184( 2) 2 180.000( 3) --------------------------------------------------------------------------------------------------- Error termination via Lnk1e in e:\g09w\l716.exe at Mon Dec 02 21:29:13 2013. 請(qǐng)問：為何會(huì)提示180°超過計(jì)算范圍？這個(gè)在算法上是什么原因造成的？有人說(shuō)是勢(shì)能求梯度時(shí)報(bào)錯(cuò)造成的。 我將角度修改為179°時(shí)，運(yùn)行正常，但是當(dāng)角度優(yōu)化到180°時(shí)又報(bào)錯(cuò)了。 如果取消z矩陣的話，優(yōu)化正常結(jié)束。 求教 |
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雪狼乖乖 
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2樓2013-12-02 21:57:24
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4樓2013-12-02 22:17:46
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【答案】應(yīng)助回帖
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感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
雪狼乖乖: 金幣+10, ★★★★★最佳答案, 虛原子我設(shè)過 但是還是會(huì)死掉 第一步?jīng)]問題 第二步就game over了 2013-12-03 09:39:34
gkf高: 金幣+4 2013-12-03 10:26:29
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gkf高: 金幣+4 2013-12-03 10:26:29
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三個(gè)呈線性的分子的鍵角是不能使用的，鍵角對(duì)所有直角坐標(biāo)的偏導(dǎo)數(shù)都為0。另外，線性分子的自由度比非線性分子多1，而多出的正是對(duì)應(yīng)鍵角彎曲自由度的；在兩個(gè)垂直方向鍵角的張合構(gòu)成兩個(gè)簡(jiǎn)并自由度。要正確描述線性分子，需要設(shè)置一個(gè)虛原子，才能得到正確的3N-5個(gè)自由度。 C H 1 B1 X 1 1.0 2 90.0 N 1 B2 3 90.0 2 180.00 B1 1.06898300 B2 1.16018400 詳細(xì)解釋可以在高斯網(wǎng)站找到 http://www.gaussian.com/g_tech/g_ur/c_zmat.htm 找到Using dummy atoms這一節(jié)，就有HCN這個(gè)分子的例子。 |
6樓2013-12-03 00:40:49
7樓2013-12-03 08:19:12
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