韓歡歡

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[求助] LAMMPS中怎對(duì)體系進(jìn)行單軸壓縮已有1人參與

LAMMPS中怎么對(duì)體系進(jìn)行單軸壓縮，是以一定的應(yīng)變率進(jìn)行壓縮的，請(qǐng)教下在lammps中用什么命令實(shí)現(xiàn)

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Demi

1樓 2013-12-09 15:55:17

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ashioulou

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deform
剩下的你自己看網(wǎng)站上的commands就知道了

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2樓2013-12-09 16:22:20

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韓歡歡

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引用回帖:

2樓: Originally posted by ashioulou at 2013-12-09 16:22:20
deform
剩下的你自己看網(wǎng)站上的commands就知道了

你好，我用了fix deform做了壓縮，周期性邊界條件，單軸z向壓縮，可是怎么老是出現(xiàn)這個(gè)問(wèn)題，fix 6 all deform 10 z erate -0.0005 units box
ERROR: Final box dimension due to fix deform is < 0.0 (../fix_deform.cpp:475)。我最大壓縮量是20%，timestep是0.001，跑了4000000步，是什么問(wèn)題呢？求指教

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Demi

3樓2013-12-17 10:03:49

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ashioulou

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月只藍(lán): 金幣+1, 鼓勵(lì)交流！ 2013-12-18 08:54:36

引用回帖:

3樓: Originally posted by 韓歡歡 at 2013-12-17 10:03:49
你好，我用了fix deform做了壓縮，周期性邊界條件，單軸z向壓縮，可是怎么老是出現(xiàn)這個(gè)問(wèn)題，fix 6 all deform 10 z erate -0.0005 units box
ERROR: Final box dimension due to fix deform is < 0.0 (.. ...

就是壓太大了錯(cuò)誤寫得很明顯:Final box dimension due to fix deform is < 0.0
我建議你可以把錯(cuò)誤的log.lammps檔拿出?磣x一讀自己算算看你給的commands是不是真的如你所想的那樣
fix 6 all deform 10 z erate -0.0005 units box <是每10步執(zhí)行一次工程應(yīng)變-0.0005 跟timestep沒(méi)有關(guān)係跟你的總步數(shù)有關(guān)係
意思就是說(shuō)每10步壓縮0.0005 總共4000000 所以壓縮了400000*0.0005早就超過(guò)1 完全不合理!!
官網(wǎng)上的commands寫得很清楚建議你出問(wèn)題再讀仔細(xì)一點(diǎn)

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4樓2013-12-17 21:05:24

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4樓: Originally posted by ashioulou at 2013-12-17 21:05:24
就是壓太大了錯(cuò)誤寫得很明顯:Final box dimension due to fix deform is < 0.0
我建議你可以把錯(cuò)誤的log.lammps檔拿出?磣x一讀自己算算看你給的commands是不是真的如你所想的那樣
fix 6 all deform 10 z ...

你好，最后的應(yīng)變不是這么計(jì)算的嗎：strain最后是無(wú)量綱的，所以要*timestep再乘以run的步數(shù)啊，

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Demi

5樓2013-12-17 22:30:10

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-0.0005是應(yīng)變率單位是/ps ，應(yīng)變不該這么計(jì)算？strain rate 0.0005*timestep 0.001 *每10不壓縮一次(run 4000000/10)*100%=20%

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Demi

6樓2013-12-17 22:47:14

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韓歡歡: 金幣+10, ★有幫助 2013-12-18 17:20:36
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????????h????????erate -0.0005 ??С??c????????M?r?g?s????c
????????????run??? ??????run??ε?in???
???????x?x????output???????????????????
????ε???????????CLAMMPS???????N???

deform?????????timestep?ж??]???P?S
?????timestep=0.0001????1000 ????????????????Α??-0.00005
????????r?? -0.0001 ??????? -0.00015.....

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7樓2013-12-18 14:19:17

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???????:

7?: Originally posted by ashioulou at 2013-12-18 14:19:17
????????h????????erate -0.0005 ??С??c????????M?r?g?s????c
????????????run??? ??????run??ε?in???
???????x?x????output???????????????????
????ε???????????CLAMMPS???? ...

??????????????????????????????????run400??????????
???????????????????????????????????????????????????????????????strain rate -0.01 ,run??20000????timestep ??0.001?????1?????0.01???????????????????????https://icme.hpc.msstate.edu/med ... LAMMPS_input_script

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8樓2013-12-18 17:24:17

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8樓: Originally posted by 韓歡歡 at 2013-12-18 17:24:17
嗯，我先試試您說(shuō)的這個(gè)方法。如果這樣我run400步就可以了。
不過(guò)我還是有疑問(wèn)，發(fā)了了連接您，這個(gè)是在網(wǎng)上看的單軸壓縮例子，例子中是strain rate -0.01 ,run了20000步，timestep 是0.001，是每1步壓縮0.01，照 ...

先謝謝您耐心的回復(fù)哈

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Demi

9樓2013-12-18 17:24:59

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leoluode

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9樓: Originally posted by 韓歡歡 at 2013-12-18 17:24:59
先謝謝您耐心的回復(fù)哈...

不知道樓主現(xiàn)在還在做分子模擬沒(méi)有？想問(wèn)您一下，最后您的應(yīng)變計(jì)算出來(lái)還是20%嗎

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10樓2016-07-25 11:45:13

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