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[求助]
有沒有會做啊 ？我想死的心都有了啊。。。DNA酶切模擬軟件�；蛉S結(jié)構(gòu)觀察等等 已有1人參與
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Sample Text 利用軟件模擬該基因酶切后的電泳情況，查找該基因是否有已知的三維結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)，并下載該結(jié)構(gòu)文件，用相關(guān)軟件觀察，分析該蛋白有無MHC-I類和II類分子的結(jié)合多肽序列。 |
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3樓2013-12-15 21:27:55
hl16010921
木蟲 (正式寫手)
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【答案】應(yīng)助回帖
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感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
chin_jl: 金幣+10, ★★★很有幫助 2013-12-15 21:26:16
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1.lZ想要的是蛋白的三維結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)吧，http://www.rcsb.org/上有蛋白的三維結(jié)構(gòu)。 2.短肽類一般不具有典型的三維結(jié)構(gòu)。構(gòu)象是多個結(jié)構(gòu)。蛋白的片段有時不具備穩(wěn)定的三級結(jié)構(gòu)。 3.MHC分子理論上能遞呈所有的長度合適的肽段吧，所以LZ要如何判斷結(jié)合序列呢？難道計算非遞呈的肽和MHC的結(jié)合？ 4.由于MHC多態(tài)性的存在，總不能將某一MHC分子作為標(biāo)準(zhǔn)進行計算吧，如何選擇MHC分子呢？不明覺厲。  還望指教。 |
2樓2013-12-13 15:36:55
hl16010921
木蟲 (正式寫手)
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我按記憶大致說說吧，可能有小錯誤 。MHC可以認(rèn)為是一類遞呈抗原的蛋白，1類遞呈降解的蛋白片段（包括病毒的蛋白），二類是由抗原遞呈細(xì)胞遞呈的肽段。一般MHC都有一個結(jié)合肽段的肽槽，在抗原遞呈過程中抗原肽倍封閉到肽槽中，MHC可以同T細(xì)胞的TCR識別，形成類似夾心結(jié)構(gòu)的抗原肽復(fù)合物�？乖拈L度在8到12肽左右，理論上MHC能遞呈全部的多肽。同時MHC具有高度的多樣性，無親緣關(guān)系的MHC相容的概率在百萬分之一左右（此數(shù)記不清了，你查查百度）所以可以認(rèn)為每個個體的MHC的結(jié)構(gòu)都是有區(qū)別的，而且每個蛋白片段都能被遞呈，這作業(yè)咋做呀。MHC和抗原肽的結(jié)合有偏好性，可能從者方面下手吧，計算至少也給個大概的理論模型呀 |
4樓2013-12-16 09:51:10
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