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hongsemenghuan木蟲(chóng) (著名寫(xiě)手)
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找過(guò)渡態(tài)時(shí)為什么命令語(yǔ)句中有“geometry=connectivity,或nosystem”就不能執(zhí)行任務(wù)？
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| 如題，試著找過(guò)渡態(tài)，命令中添加上“geometry=connectivity,或nosystem”，提交作業(yè)后就顯示”C“。為什么呢？歡迎交流！ |
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hongsemenghuan
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2樓2013-12-19 16:13:56
userhung
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3樓2013-12-19 16:40:00
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小木蟲(chóng): 金幣+0.5, 給個(gè)紅包，謝謝回帖
gmy1990: 金幣+2 2013-12-19 20:53:14
小木蟲(chóng): 金幣+0.5, 給個(gè)紅包，謝謝回帖
gmy1990: 金幣+2 2013-12-19 20:53:14
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geometry=connectivity 對(duì)此zhangmt專(zhuān)家顧問(wèn)說(shuō)： ————事實(shí)上，量化計(jì)算時(shí)不考慮所謂的鏈接關(guān)系表，那個(gè)geometry=connectivity僅在動(dòng)力學(xué)模擬以及半經(jīng)驗(yàn)計(jì)算時(shí)，才會(huì)考察。而在量化計(jì)算中，是起不到任何作用的。他的問(wèn)題之所以出錯(cuò)，可能是他雖然在命令行里寫(xiě)了geometry=connectivity，可是后面坐標(biāo)之后可能沒(méi)有寫(xiě)這段連接關(guān)系表，或者刪掉了，所以程序讀數(shù)據(jù)時(shí)出錯(cuò)�；蛘�，他在命令行里，前面有類(lèi)似于genecp之類(lèi)的同樣要讀附加信息的命令，程序可能會(huì)把連接關(guān)系表當(dāng)成贗勢(shì)來(lái)讀，也會(huì)出錯(cuò)。總之，在量化計(jì)算中，寫(xiě)geometry=connectivity以及后面保留鏈接關(guān)系表，都是一個(gè)愚蠢無(wú)用的做法。 nosystem 對(duì)此zhangmt專(zhuān)家顧問(wèn)說(shuō)： ————根本就沒(méi)有nosystem這個(gè)關(guān)鍵詞。那個(gè)對(duì)稱(chēng)性的英文是symmetry, 禁止對(duì)稱(chēng)性應(yīng)寫(xiě)作nosymmetry, 或者簡(jiǎn)寫(xiě)成nosymm都可以，但是胡亂寫(xiě)成nosystem的，就是胡說(shuō)八道了，當(dāng)然會(huì)報(bào)錯(cuò)。事實(shí)上，在尋找TS的過(guò)程中，完全可以nosymm，沒(méi)問(wèn)題的。。nosymmetry強(qiáng)迫程序不去考慮對(duì)稱(chēng)性，會(huì)加大運(yùn)算量，增加運(yùn)算時(shí)間，但在特定的情況下，有時(shí)候會(huì)找到限制對(duì)稱(chēng)性所找不到的過(guò)渡態(tài)（如你所言），同樣在特定的情況下，也會(huì)造成應(yīng)該找到的特定過(guò)渡態(tài)反而找不到了。 [ Last edited by zhou2009 on 2013-12-20 at 07:39 ] |
4樓2013-12-19 17:36:43
hongsemenghuan
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5樓2013-12-20 08:17:46
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